当前解析结果
SmilChr02G005254| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005254 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005254 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005254 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73660139 - 73662175 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009324 |
|---|---|
| GeneID | 131009324 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009324 |
| 原始查询 | SmilChr02G005254 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009324 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057792606.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057792606.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057792606.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792606.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792606.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73660331 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr2:73660337 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,A2,B100,B94 |
Chr2:73660352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B2,C60,D7 |
Chr2:73660409 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B129,B137,D1 |
Chr2:73660445 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 108 | A15,A16,A2,A20,A21,A24,A3,A6,A9,B1,B100,B104,B106,B107,B108,B109,B114,B12,B122,B123,B124,B128,B129,B132,B133,B137,B16,B17,B2,B25,B26,B38,B4,B42,B43,B45,B46,B49,B5,B51,B56,B58,B59,B60,B62,B64,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B77,B81,B82,B85,B89,B91,B93,B94,B96,B98,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C24,C26,C28,C30,C31,C34,C38,C39,C42,C45,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C60,C62,C67,C70,C71,C72,C73,C76,C78,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D7,D8 |
Chr2:73660469 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr2:73660579 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C39 |
Chr2:73660579 |
A |
AAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr2:73660581 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C82 |
Chr2:73660581 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr2:73660604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr2:73660671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B121,B138,C13,C57 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。