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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005263`

染色体: Chr02 坐标: 73718345-73722996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005263`
名称	SmilChr02G005263
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73718345 - 73722996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009201`
GeneID	`131009201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009201`
原始查询	`SmilChr02G005263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
产物	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
Arabidopsis	`AT1G53050` (AT1G53050) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841739] identity=54; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0112500` (Orysa) - identity=54.8; qcov=0.866; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0008353 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity); GO:0032968 (positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792438.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057792438.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057792438.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792438.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792438.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73718750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:73718771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B75,B82
`Chr2:73718804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:73719129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B70,C48,D2
`Chr2:73719151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73719185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C7
`Chr2:73719268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C47
`Chr2:73719307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B8,C43
`Chr2:73719352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B135,B28,C85,D9
`Chr2:73719702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:73719703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B8,C43
`Chr2:73719723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792438.1

702 aa

351

702

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 132-416 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 135-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792438.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	132	416	3.5e-68	230.6	Protein kinase domain
`XP_057792438.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	135	345	2.4e-31	109.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936455.1
TAATACATATACGCACTCACGATAACATATGTAAGCAAGAATATCGAATTTTGGCCCATCGATGGTGCTTCAAGTGGGGTCTTTTAAGCTCTCAAATCGTGAAATTTATATAGTATTTATATAATTTCTTTCTATAATTTGTGAGATTATTTTACCAAAATTATAATTTACTCACAAACCTTTGTGAGCAACAATTGCAGGTTTACTTTACATTCGAAAAGGAATCTCGAATATTATCACTTCCTTTTTTCTTTTCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009201
ATGGGGTGTGTTTGTGGGAAGCCATCTTCAGCAGTTGAAGATAGTGAGGTGAGCCCAAAACAGAGAGACCTGATTAGGAAGGCTTCTGAACTGCGTTTGGCTAGAGGGGTTTCTTCGAGAAGGAATGAGAGTTTCTCATTGAAGGAGAGTTTGGAGAATGGTGATGTTAAAATTGGGTTGATTGATAAGAAGGTTAGTGGGTCTAGGAAGGTGAGGGATGATTACTATGAGAAGAGGAAAGGGAGCTGTGAGGATCTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792438.1
MGCVCGKPSSAVEDSEVSPKQRDLIRKASELRLARGVSSRRNESFSLKESLENGDVKIGLIDKKVSGSRKVRDDYYEKRKGSCEDLGGNFPSLGSLPRAVEGEQVAAGWPSWLVAVAGEAIRGWTPRKADTFEKLDKIGQGTYSSVYKGRDLLTNKYVALKKVRFDNMDPESVKFMAREILILRRLDHPNIIKLEGLVTSRTSSSLYLVFEYMEHDLTGLASLPGVRFTEPQVKCYMKQLLSGLDYCHSNGVLHRDIKGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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