当前解析结果
SmilChr02G005273| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005273 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005273 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005273 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73812537 - 73813490 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009977 |
|---|---|
| GeneID | 131009977 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009977 |
| 原始查询 | SmilChr02G005273 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0636200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0636200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0636200- identity=31.2; qcov=0.505; evalue=2.02e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009977 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057793355.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057793355.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057793355.1 |
| 4 | Golgi stack | 高尔基堆 | 0.20000 | XP_057793355.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793355.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73812593 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:73812607 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:73812659 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C47 |
Chr2:73812767 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:73812803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,C57 |
Chr2:73812847 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B57,B62 |
Chr2:73812968 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr2:73813012 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,D11 |
Chr2:73813025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,A20,C70 |
Chr2:73813061 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B134,B27,C71,C9 |
Chr2:73813063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B44,C53,C63 |
Chr2:73813109 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B114,B69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。