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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005278`

染色体: Chr02 坐标: 73837620-73838616 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005278`
名称	SmilChr02G005278
描述	uncharacterized SmilChr02G005278
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73837620 - 73838616 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009311`
GeneID	`131009311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009311`
原始查询	`SmilChr02G005278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821607]; symbol=NDR1; hit=AT3G20600; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821607]; symbol=NDR1; hit=AT3G20600; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G20600` (NDR1) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821607] identity=27.4; qcov=1.05; evalue=2.08e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792592.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792592.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792592.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792592.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73837803`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A13,A16,A18,A25,A6,B100,B107,B11,B111,B12,B122,B131,B138,B140,B15,B17,B22,B52,B54,B56,B59,B66,B85,B9,B95,C1,C16,C17,C28,C3,C32,C38,C43,C44,C48,C58,C64,C66,C68,C73,C74,C75,C77,D2
`Chr2:73837807`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A13,A16,A18,A25,A6,B100,B107,B11,B111,B12,B122,B131,B138,B140,B15,B17,B22,B52,B54,B56,B59,B66,B85,B9,B95,C1,C16,C17,C28,C3,C32,C38,C43,C44,C48,C58,C64,C66,C68,C73,C74,C75,C77,D2
`Chr2:73837873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:73838148`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr2:73838148`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr2:73838160`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:73838160`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:73838248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B23
`Chr2:73838250`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A1,A4,B110,B114,B125,B14,B25,B29,B34,B4,B50,B52,B55,B67,B88,C23,C6,C61,C81,C84
`Chr2:73838263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr2:73838284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:73838294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936609.1
TTGAAGTGTCCAATGCAAAGCCATTGGACAAGGTATAATAATAATTCGATCAAATCGTGATGAATAACCTTGCTGTTTACATAGTAATTTACACAGATCCAACAATAAATATATACTCATCCCATAACTTATTCTTACAAAAAAAAAAAACACCAATAATTAAGTTCTCAAATTTGTAATGGATGATGATGATGGCGGCGCAGCATGCTGCCTCATCTGCGCATGTATCATCATCATAGTTCTTCCCATAACCCTAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009311
ATGGATGATGATGATGGCGGCGCAGCATGCTGCCTCATCTGCGCATGTATCATCATCATAGTTCTTCCCATAACCCTAATTTCACTAAGCCTGAAAACCCACAACCCCAAAATCGACGTCGAAGATCTCTACATTCCGGCGATCAACGGCATGGCCGGGTCCAACGCGACGCGGCTCAACACCTTCATCTTCATCGACCTCAGCCTCCGCAACGTCATGCGCTTCAACGGCCTCCGCTACGAGGCGCTCAACCTCACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792592.1
MDDDDGGAACCLICACIIIIVLPITLISLSLKTHNPKIDVEDLYIPAINGMAGSNATRLNTFIFIDLSLRNVMRFNGLRYEALNLTFFYGGNRSAAVAEAAVPGFYQGVWKTARKTAVVRTSGLPWDDAFDRISRGLTVDLAVQLAMTVKLRRCGVYMKRKEVVVAAVVSLDGSGEEVDEKVVGLNELKPSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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