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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005286`

染色体: Chr02 坐标: 73887051-73890068 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005286`
名称	SmilChr02G005286
描述	uncharacterized SmilChr02G005286
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73887051 - 73890068 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009271`
GeneID	`131009271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009271`
原始查询	`SmilChr02G005286`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G03420; symbol=AT4G03420; hit=AT4G03420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT4G03420; symbol=AT4G03420; hit=AT4G03420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G03420` (AT4G03420) - identity=67; qcov=0.974; evalue=9.25e-98; confidence=high
Rice	`Os10g0494000` (OSJNBa0041P03.5) - identity=48.6; qcov=0.936; evalue=2.33e-67; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05623 (DUF789)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792540.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792539.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792539.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057792539.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73887974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:73888496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:73888559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D11
`Chr2:73889319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B100,B22,C56
`Chr2:73889506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B36,B38,B39
`Chr2:73889529`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A13,A14,A16,A19,A5,A8,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B109,B115,B118,B12,B122,B123,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B14,B16,B17,B32,B34,B4,B45,B46,B47,B50,B51,B53,B55,B57,B58,B63,B65,B69,B72,B73,B74,B76,B78,B8,B93,B95,B97,B98,B99,C11,C16,C17,C2,C23,C27,C28,C35,C36,C37,C38,C39,C42,C46,C51,C57,C58,C59,C69,C70,C74,C80,C82,D1,D11,D3,D6,D7,D9
`Chr2:73889623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C43
`Chr2:73889705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C39
`Chr2:73889718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B124,B7,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792539.1

317 aa

158

317

DUF789

PF05623 DUF789 10-311 aa

XP_057792540.1

233 aa

116

233

DUF789

PF05623 DUF789 10-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792539.1`	Pfam	`PF05623`	DUF789	Family	10	311	4.2e-111	372.0	Protein of unknown function (DUF789)
`XP_057792540.1`	Pfam	`PF05623`	DUF789	Family	10	223	1.7e-75	255.1	Protein of unknown function (DUF789)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936556.1
TGTGTGTAGGCGTTAAAAGTCTTCAGTTTCTCTTCCTTTCTCCCTCACACACTACACACACTTGGAGCACGTTTACTACCTCTGTGCTCTCTTGCGCCAGATTCTTGTATGAATAAAAACCAAAACTACAGCTTTTTTTTCTTCTTTTCTTTTTCGATGAGAAAGTGGATTCCCTTTTATCAGAAACCATGGAATTCCACCTGAGAATATATACAAAAGTGAAAAGATAAATTCATTCTTCTTGGCTTAGTTTTGGGAAT...

XM_057936557.1
GTTTTCTTGTCCAAACGTCAAAGAGCAGTAATCTCTGTTGTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCTAATTTCTCTCTCCCTCTCCCATTAAATTCCTTTTTCTCTTGCTCTGTTTCCTTCCTCTCTCCCTCGGCTCTCTTTTCCTCTGTTTTTTTTCCTAGAGAAATAGGAGAGAGAATCAGAGCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGATTTAAAACCATGATCTTTGACAAGGTTCCGATGCAAACAAACCTTGAATGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009271
ATGATCTTTGACAAGGTTCCGATGCAAACAAACCTTGAATGCTTCTTGGATTGCACAACTCCTGTGGTCCCATCTCAATTCTTGTCCAAGAGTGAGACGAGGAAGCTCAATAGGCTATGGCATCCATGGGAAAGAGAAAAAGTAGACTACTTCACTCTCGGTGATCTCTGGAGCAGCTTCGACGAATGGAGCGCCTGCGGCGCCGGCGTTCCGGTCATCTCCGACGACGGCCAGAATTTGATCCAATATTTCGTGCCTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792539.1
MIFDKVPMQTNLECFLDCTTPVVPSQFLSKSETRKLNRLWHPWEREKVDYFTLGDLWSSFDEWSACGAGVPVISDDGQNLIQYFVPYLSAIQIFTSTSSANSLREESDSVSETRDSCSDSLSDESESEKVSSRWDRCSSEEGMSEHDGFCHPNGRLGNLYFQYFEKSSPYGRVPLVDKIGSLAQRYPGLMSLRSVDLSPASWMAVAWYPIYHIPAGRTVKDLQACFLTYHTLSSSFQDMDLEGDGEHVKRRRERGECLSL...

XP_057792540.1
MIFDKVPMQTNLECFLDCTTPVVPSQFLSKSETRKLNRLWHPWEREKVDYFTLGDLWSSFDEWSACGAGVPVISDDGQNLIQYFVPYLSAIQIFTSTSSANSLREESDSVSETRDSCSDSLSDESESEKVSSRWDRCSSEEGMSEHDGFCHPNGRLGNLYFQYFEKSSPYGRVPLVDKIGSLAQRYPGLMSLRSVDLSPASWMAVAWYPIYHIPAGRTVKDLQIWILRGMAST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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