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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005295`

染色体: Chr02 坐标: 73924920-73927227 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005295`
名称	SmilChr02G005295
描述	protein SENSITIVITY TO RED LIGHT REDUCED 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73924920 - 73927227 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009284`
GeneID	`131009284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009284`
原始查询	`SmilChr02G005295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SENSITIVITY TO RED LIGHT REDUCED 1
产物	protein SENSITIVITY TO RED LIGHT REDUCED 1
Arabidopsis	`AT5G59560` (SRR1) sensitivity to red light reduced protein (SRR1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836075] identity=51.8; qcov=0.928; evalue=1.41e-100; confidence=high
Rice	`Os05g0118000` - identity=34.5; qcov=0.802; evalue=6.58e-26; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007017 (microtubule-based process)
KEGG	-
Pfam	PF07985 (SRR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792561.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792561.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792561.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73925059`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	66	A14,A19,A22,A6,A8,B1,B101,B109,B11,B110,B113,B119,B121,B129,B131,B133,B135,B137,B138,B140,B20,B28,B29,B37,B43,B44,B45,B5,B50,B56,B57,B6,B62,B7,B74,B75,B77,B89,B91,B93,B96,C11,C16,C21,C22,C30,C34,C35,C37,C39,C45,C46,C55,C56,C63,C69,C7,C73,C74,C81,C83,C85,C86,D1,D7,D9
`Chr2:73926221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B41,B76,C4
`Chr2:73926226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:73926298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C87
`Chr2:73926331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D10
`Chr2:73926442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73926617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:73926622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B34
`Chr2:73926777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:73926848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,D9
`Chr2:73926886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:73926892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B41,B76,C4,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792561.1

293 aa

146

293

SRR1

PF07985 SRR1 109-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792561.1`	Pfam	`PF07985`	SRR1	Domain	109	280	1.9e-39	136.0	SRR1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936578.1
ATAAAAATAAAAATAAATATGGAGAAAAAAAAAATCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACCCTACTTCTCCTTCAGAAATTTTCCTGATTTCACCGACAGCTGAAATAAGCTTCGCATATGTTATGTATTCAGAAGGATCTAAGAAGAAACTAGTGCCTGCGACGATGGCTGCTTCGGCAAAAACTCTAACTCCAGAGAGATCTGATCCATCAGAAGATTGGACTATTGTGCTACCGAGGCGTGGAAAGAAGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009284
ATGTATTCAGAAGGATCTAAGAAGAAACTAGTGCCTGCGACGATGGCTGCTTCGGCAAAAACTCTAACTCCAGAGAGATCTGATCCATCAGAAGATTGGACTATTGTGCTACCGAGGCGTGGAAAGAAGAACAGAACTGTGAACAAGTTTGTGATCCCTAAACGGCAAAAGGAAGTGCAGTTATGGGCGCCGATAGATCTTGAAACAGATCCAGAGAGAGAAGCGAAGCTGAAGCAAAAAATGGAGATTTGTATTCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792561.1
MYSEGSKKKLVPATMAASAKTLTPERSDPSEDWTIVLPRRGKKNRTVNKFVIPKRQKEVQLWAPIDLETDPEREAKLKQKMEICIQKFESSEFYRNLLSQIRNPDMLDKFSKVLGSEEKMQMVIYGIGSIESFEPPRLQLSLAILLKRSFDWIGGIELFDPIISLTESKVLASLGCSVLSVNEQGRRQALKPTLFFMPHCEAELYDNLLEVNWEVDRLNRLVIFGNSFGAYEQHASLCKSSAVSSSRKRVLAVRSFAEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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