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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005310`

染色体: Chr02 坐标: 73998728-74000883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005310`
名称	SmilChr02G005310
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73998728 - 74000883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009232`
GeneID	`131009232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009232`
原始查询	`SmilChr02G005310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
产物	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G03940` (AT1G03940) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839366] identity=32.3; qcov=1.02; evalue=1.5e-70; confidence=low
Rice	`Os02g0820400` - identity=30.6; qcov=1.01; evalue=1.18e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792479.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792479.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792479.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792479.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73998923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:73998936`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B12
`Chr2:73998936`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B12
`Chr2:73998941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:73998987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B57,B64,D1,D6
`Chr2:73999041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C48
`Chr2:73999043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C48
`Chr2:73999060`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A14,A8,B10,B107,B115,B132,B134,B37,B5,C26,C47,C7,C70
`Chr2:73999097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B41,B62,B76,C4
`Chr2:73999238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B57,B64,D6
`Chr2:73999251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B34,B53,C8
`Chr2:73999261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B3,B59,C31,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792479.1

457 aa

228

457

Transferase

PF02458 Transferase 20-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792479.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	20	451	1e-34	120.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936496.1
TACATATTGTCCACAACCACATGATTTCTACGACAAACCTAATCGACAAGACATAACATTATTTAAATTTATAAATTATTTATCATTTATAAATAGAAAGACCAAGGCCAATAATTCACTATAACCATAAGCTAAGTCCCAAACCGCCATGACCACCGTGCTTGAGACCTGCGGTATCCCTCCTCCGCCGGGCGCCGCCGCCGAGCTGACGCTGCCGCTCACCTTCCTCGACATGTTCTGGCTCCATTTCCAGCCGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009232
ATGACCACCGTGCTTGAGACCTGCGGTATCCCTCCTCCGCCGGGCGCCGCCGCCGAGCTGACGCTGCCGCTCACCTTCCTCGACATGTTCTGGCTCCATTTCCAGCCGATCCGCCGCCTCATCTTCTACAACCACCCGTGCTCGGAGGCAGAGTTCTCCAACACCGTCGTTCCCAACCTCAAACACTCTCTCTCTCTAACCCTCAAACACTATCTCCCAGTCGCCGGAAATCTCCTCTACCCTCTCGACGCCGAAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792479.1
MTTVLETCGIPPPPGAAAELTLPLTFLDMFWLHFQPIRRLIFYNHPCSEAEFSNTVVPNLKHSLSLTLKHYLPVAGNLLYPLDAEKSQPVIRYVSGDSVPLTVAISGHDFDELVGSHARESDQFYDFLPPMPPWTEEENYKITPLTALQATLFPGRGICIGLSNHHCLGDARSVVGFISAWAEIYKCGDDENFLSRNAESLPLIFDRSVFGDIGETTEKYWNRKRNIPLAPLSPPLPTNRVRAAFTLHQSDIKKLKNLVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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