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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005313`

染色体: Chr02 坐标: 74015848-74018045 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005313`
名称	SmilChr02G005313
描述	myb family transcription factor PHL7-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74015848 - 74018045 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009297`
GeneID	`131009297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009297`
原始查询	`SmilChr02G005313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb family transcription factor PHL7-like
产物	myb family transcription factor PHL7-like
Arabidopsis	`AT2G01060` (AT2G01060) myb-like HTH transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814630] identity=49.3; qcov=0.63; evalue=2.4e-47; confidence=medium
Rice	`Os05g0491500` - identity=47.9; qcov=0.693; evalue=3.15e-46; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF14379 (Myb_CC_LHEQLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792576.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792576.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792576.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792576.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74016128`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A14,A3,A8,B102,B106,B108,B11,B113,B115,B127,B13,B131,B23,B28,B3,B30,B31,B33,B41,B43,B5,B6,B62,B63,B66,B76,B79,B84,B86,B89,C21,C32,C4,C48,C63,C67,C68,C74,C76,C83,C9,D11,D2,D6
`Chr2:74016130`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	67	A14,A16,A18,A19,A3,A8,B102,B106,B108,B11,B113,B115,B118,B127,B129,B13,B131,B23,B24,B28,B3,B30,B31,B33,B40,B41,B43,B49,B5,B6,B60,B62,B63,B66,B76,B79,B8,B84,B86,B89,B98,C14,C20,C21,C31,C32,C36,C4,C43,C48,C5,C52,C54,C60,C63,C67,C68,C74,C76,C79,C83,C86,C87,C9,D11,D2,D6
`Chr2:74016135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:74016206`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B127,B129,B132,B41,B62,C54,C60,C79
`Chr2:74016209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C27
`Chr2:74016261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B124,B7
`Chr2:74016273`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A14,A3,A8,B102,B107,B113,B13,B131,B23,B3,B31,B37,B42,B43,B5,B56,B66,B79,B96,C21,C32,C48,C55,C68,C74,D1,D11,D2,D6
`Chr2:74016312`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	150	A1,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A3,A5,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B113,B115,B118,B120,B121,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B140,B17,B2,B23,B24,B25,B26,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B40,B41,B42,B43,B45,B48,B49,B5,B51,B54,B56,B6,B60,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B70,B72,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B86,B89,B91,B93,B94,B96,B97,B98,C10,C12,C13,C14,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C31,C32,C33,C34,C36,C39,C4,C43,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C59,C60,C61,C63,C68,C72,C74,C76,C78,C79,C80,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr2:74016367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B82
`Chr2:74016372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B124,B7
`Chr2:74016374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:74016390`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A16,A19,A5,A7,A8,B1,B103,B108,B110,B118,B122,B126,B128,B137,B140,B2,B24,B25,B29,B33,B35,B36,B40,B49,B51,B54,B60,B67,B68,B70,B77,B78,B8,B80,B81,B83,B86,B94,B98,C14,C2,C20,C23,C31,C32,C34,C36,C43,C48,C5,C51,C52,C59,C68,C74,C80,C85,C86,C87,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792576.1

238 aa

119

238

Myb_DNA-binding

Myb_CC_LHEQLE

PF00249 Myb_DNA-binding 10-61 aa PF14379 Myb_CC_LHEQLE 95-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792576.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	10	61	1.2e-08	35.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057792576.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	95	138	2.5e-19	69.4	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936593.1
ATTTGATCCTAGTTGAGATCGCCTAGCAATGAATTTTGTATTTTAAGTGAGTGATTATTTGGTGAGAGATTATTTGGTGAGACAACATGGGGTCTCACCGGTCGTCCAAGGAGAGGCTCAAGTGGACCAAGGAATTGCACGACTTGTTCGAGAAGGCAGTCAATCAGATTGGAGGTCCAGATAGAGCAACTCCCAAAGGTATTCTGAAAGCTATGGCTATTCCCGGATTGACCATCTTTCATGTCAAGAGTCACCTACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009297
ATGGGGTCTCACCGGTCGTCCAAGGAGAGGCTCAAGTGGACCAAGGAATTGCACGACTTGTTCGAGAAGGCAGTCAATCAGATTGGAGGTCCAGATAGAGCAACTCCCAAAGGTATTCTGAAAGCTATGGCTATTCCCGGATTGACCATCTTTCATGTCAAGAGTCACCTACAGAAGTACAGGATGTCGGTATTCACTCGAGAAGAAGACCATACCAAAGGCAAGCTCGAGAGACGGAGCGTATCCGAGATGCTTCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792576.1
MGSHRSSKERLKWTKELHDLFEKAVNQIGGPDRATPKGILKAMAIPGLTIFHVKSHLQKYRMSVFTREEDHTKGKLERRSVSEMLPNFCALSGAQLNEALLIQMEAQRRLSDQLEVQKSLKMKIEAQGRFLDKIMEEYKNRSPAGTKPYSPILSLPSLSDESDSDVEDVSEISSKEDFQPPKRIKIQQHHNLPCFNLDSHHLNLFSVDGITNQELAFPWVDRALSPSPLLGMYNHLNR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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