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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005316`

染色体: Chr02 坐标: 74044426-74047325 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005316`
名称	SmilChr02G005316
描述	flavanone 3-dioxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74044426 - 74047325 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009252`
GeneID	`131009252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009252`
原始查询	`SmilChr02G005316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavanone 3-dioxygenase 2-like
产物	flavanone 3-dioxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT3G60290` (AT3G60290) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825200] identity=42.4; qcov=0.774; evalue=2.36e-86; confidence=medium
Rice	`Os10g0536400` (OsF3H-2) - identity=42.6; qcov=0.776; evalue=6.93e-85; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792511.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792511.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792511.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74044582`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A18,B63,B72,B97,C14,C18,C55
`Chr2:74044586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr2:74044608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,B77,C42,C47,D5
`Chr2:74044610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,B77,C42,C47,D5
`Chr2:74044611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B17,B85,C44,D3
`Chr2:74044642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:74044645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B6
`Chr2:74044676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B136,C55,D1
`Chr2:74044680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C43
`Chr2:74045792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B136,C55,D1
`Chr2:74045807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:74045812`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A4,A6,A9,B125,B128,B22,B46,B48,B71,B98,C18,C29,C36,C38,C49,C64,C66,C76,C79,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792511.1

402 aa

201

402

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 96-207 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 253-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792511.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	96	207	3.6e-27	96.1	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057792511.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	253	346	2.3e-33	115.3	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936528.1
ATGAATTTGCAGCAAAAACTTACACGTTTAGCTCTTGTTCACATATTTGAACTACTTCAACAACCCCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTAACATGTCGGCCGGAATCGCCTACTCTACGACCAAAGTCTCCGAGGGAGACGAAGCCGAGGACGTCGATGTTGCTACATTCGATTTCAAGAAAGGGGTCAAGAATCTTGTTGATACTGTGCCAAAGTTGAACAAGTTGCCATCTCAATTCATTCTACCTTTAGAGAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009252
ATGAATTTGCAGCAAAAACTTACACGTTTAGCTCTTGTTCACATATTTGAACTACTTCAACAACCCCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTAACATGTCGGCCGGAATCGCCTACTCTACGACCAAAGTCTCCGAGGGAGACGAAGCCGAGGACGTCGATGTTGCTACATTCGATTTCAAGAAAGGGGTCAAGAATCTTGTTGATACTGTGCCAAAGTTGAACAAGTTGCCATCTCAATTCATTCTACCTTTAGAGAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792511.1
MNLQQKLTRLALVHIFELLQQPLSLTLSLSNMSAGIAYSTTKVSEGDEAEDVDVATFDFKKGVKNLVDTVPKLNKLPSQFILPLERNPLFVNYAHIPIIDISVLYGASQTRVSTVEAIGSACRDWGIFTIINHGIKEALVKEMMEVAEEFFGLNLSEKMKYASDDVMSPVRYGTSLNTSKKHNLHWRDFFRHYGHPFQDTFHLWPLNPPNYRNVARVYLEQLWEMAMKIFEAISEGLGLEKRYIEESLGEGVQILAANYY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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