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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005329`

染色体: Chr02 坐标: 74141865-74143248 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005329`
名称	SmilChr02G005329
描述	uncharacterized SmilChr02G005329
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74141865 - 74143248 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009301`
GeneID	`131009301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009301`
原始查询	`SmilChr02G005329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-box type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828839]; symbol=BBX28; hit=AT4G27310; species=arabidopsis; confidence=low
产物	B-box type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828839]; symbol=BBX28; hit=AT4G27310; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G27310` (BBX28) B-box type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828839] identity=48.6; qcov=0.317; evalue=2.1e-27; confidence=low
Rice	`Os08g0178800` (OsBBX24) - identity=63.8; qcov=0.197; evalue=2.42e-24; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792581.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792581.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792581.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792581.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792581.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74142136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B114,B125
`Chr2:74142156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:74142250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B95,C29,C40,C60,D3
`Chr2:74142529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B124
`Chr2:74142624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:74142795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:74142850`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A18,A21,B105,B15,B4,B49,B60,B7,B74,C9
`Chr2:74142859`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	108	A1,A10,A18,A21,A22,A25,A5,A7,B101,B102,B103,B104,B105,B107,B108,B117,B12,B121,B122,B127,B130,B131,B133,B138,B14,B15,B17,B2,B20,B23,B24,B25,B28,B29,B31,B4,B42,B43,B49,B52,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B7,B74,B78,B8,B84,B85,B86,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C11,C16,C17,C20,C22,C23,C24,C27,C29,C30,C31,C34,C38,C40,C43,C44,C47,C49,C50,C53,C57,C58,C60,C61,C63,C67,C69,C7,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D7,D8
`Chr2:74142891`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A16,A8,B110,B126,B36,B40,B49,B86,B88,C14,C36,C52,C87
`Chr2:74142900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B45,B72,C84
`Chr2:74142909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B36,C3
`Chr2:74142935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936598.1
AGTGATTGATTAGGGAATGATATTTTGCTTTCTTAATAATTTGGTGGCCAAATTTGGTCCGACTATCCAAATCAATGCCTCCCATCGTGGGGGTGGCAATTTGGTAATTTCAGCTATGAAGGAGGGTCGTTTTGACTGCAAGTTGAATTTAAGTTATTTCTTTCTTCCTTCTTTTTTTGCTTCTTCTCTTTCCTTCCTTTCCCATATCTATCTCCTTCACATTTACATTTCTCTCTTATTTCAACTGCAAAATCTCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009301
ATGATATTTTGCTTTCTTAATAATTTGGTGGCCAAATTTGGTCCGACTATCCAAATCAATGCCTCCCATCGTGGGGGTGGCAATTTGGTAATTTCAGCTATGAAGGAGGGTCGTTTTGACTGCAAGTTGAATTTAAGTTATTTCTTTCTTCCTTCTTTTTTTGCTTCTTCTCTTTCCTTCCTTTCCCATATCTATCTCCTTCACATTTACATTTCTCTCTTATTTCAACTGCAAAATCTCTTATCCTTTTCTTCATCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792581.1
MIFCFLNNLVAKFGPTIQINASHRGGGNLVISAMKEGRFDCKLNLSYFFLPSFFASSLSFLSHIYLLHIYISLLFQLQNLLSFSSSSDSDFDLSFLRQRVFRFDFGHFCFRIGDFRFISSKKKNSKKIGMKKACELCKQAARICCESDQASLCWDCDAKVHSANFLVARHSRNLLCRVCQSPTSWSAAGSKLEPTYSACRKCARKTVCDGEDEEEEKAVEEEEEMAENHVVPWSPPPDSSLSGGEAVVHGGEAAVVRKRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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