当前解析结果
SmilChr02G005330| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005330 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005330 |
| 描述 | cytochrome P450 81Q32-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 74144165 - 74150955 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009990 |
|---|---|
| GeneID | 131009990 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009990 |
| 原始查询 | SmilChr02G005330 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 81Q32-like |
| 产物 | cytochrome P450 81Q32-like |
| Arabidopsis | AT5G36220 (CYP81D1)cytochrome p450 81d1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833619] identity=41.8; qcov=0.975; evalue=1.26e-129; confidence=medium |
| Rice | Os03g0760200 (bel)- identity=42.1; qcov=0.968; evalue=1.47e-122; confidence=medium |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009990 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057793367.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057793367.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793367.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793367.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793367.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:74144167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B30,B35,B79 |
Chr2:74144212 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr2:74148591 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 33 | A13,A20,A21,A23,A4,B10,B101,B102,B105,B114,B122,B13,B18,B19,B2,B23,B3,B4,B57,B60,B74,B92,B95,C13,C29,C40,C49,C54,C60,C8,C81,C84,C9 |
Chr2:74148617 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A11,B28,B41,B76,B85 |
Chr2:74148617 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A11,B28,B41,B76,B85 |
Chr2:74148620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B28,B41,B76,B85 |
Chr2:74148642 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr2:74148795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,A5,B2,B93,C72 |
Chr2:74148882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr2:74148923 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr2:74148925 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C9 |
Chr2:74148925 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057793367.1PF00067
p450 68-506 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057793367.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 68 | 506 | 3.3e-79 | 267.5 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。