当前解析结果
SmilChr02G005331| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005331 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005331 |
| 描述 | calcium-binding protein KRP1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 74151935 - 74153381 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009328 |
|---|---|
| GeneID | 131009328 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009328 |
| 原始查询 | SmilChr02G005331 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | calcium-binding protein KRP1-like |
| 产物 | calcium-binding protein KRP1-like |
| Arabidopsis | AT4G27280 (AT4G27280)Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828836] identity=64; qcov=1; evalue=3.12e-45; confidence=medium |
| Rice | Os06g0683400 (OsCCD1)- identity=64.4; qcov=0.937; evalue=8.11e-40; confidence=medium |
| GO | GO:0005509 (calcium ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13833 (EF-hand_8) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009328 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057792610.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057792610.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057792610.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792610.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792610.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792610.1PF13833
EF-hand_8 35-87 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792610.1 |
Pfam | PF13833 |
EF-hand_8 | Domain | 35 | 87 | 6.4e-20 | 71.4 | EF-hand domain pair |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。