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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005334`

染色体: Chr02 坐标: 74162934-74171561 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005334`
名称	SmilChr02G005334
描述	tetratricopeptide repeat protein SKI3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74162934 - 74171561 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009193`
GeneID	`131009193`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009193`
原始查询	`SmilChr02G005334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetratricopeptide repeat protein SKI3
产物	tetratricopeptide repeat protein SKI3
Arabidopsis	`AT1G76630` (AT1G76630) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843996] identity=54.4; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0548200` (OsBSR-K1) - identity=48.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0034427 (GO:0034427); GO:0055087 (Ski complex)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13174 (TPR_6); PF13181 (TPR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009193

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792428.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792428.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057792428.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792428.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74163292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:74163613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C43
`Chr2:74163745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B74,C28
`Chr2:74164066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B79
`Chr2:74164085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:74164108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:74164133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B21,B98,C49
`Chr2:74164162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C38,C79
`Chr2:74164252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:74164339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B17,B62,C44,D3
`Chr2:74164371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B13
`Chr2:74164479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C48,C73,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792428.1

1175 aa

588

1175

TPR_6

TPR_8

PF13174 TPR_6 137-168 aa PF13181 TPR_8 169-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792428.1`	Pfam	`PF13174`	TPR_6	Repeat	137	168	9.7e-06	26.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057792428.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	169	200	1.9e-08	34.5	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936445.1
AAACAAAATTAGGGTTTCTTAGAAACAAAATTAGGGTTTCGAGAGAGCAATTAAGGAACTCAAAACTTTTTATACAACTTCATACAGATAGAAAATAAAAAATCGAGGGAAATTTTGAGGTATATTTAGAAATTAGAGTTACCACCAAAAAAAAAAAAACGATTTTGAAAGGGCACAGTTGAACTCATCTTCAACTCAAGCTCAATTTATTTTGATTCGAGCAAAGTGAAATCCTGTTTACCGCAGACGCCATGGCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009193
ATGGCTCTGGCAGAAGAGGAAGACGAATTCTCCGCTTTAAAGCAATTGCAGGAAACAGCGAGTTCCAATCCGGATGACTTTACTGTCCGTTTTAATCTGGGAGTATTGCTATGGGAGAAGGGGGAGGGAAGGCCAGAACTGAGGCACGAAGCGGTGGAGCATTTCATGGTAGCGGCTAAACTCAACCCTCAGAATGCCGCTGCATTTAGATATTTGGGCCATTACTATACTCGCGTCTCGCCTGAGCCCCAGCGAGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792428.1
MALAEEEDEFSALKQLQETASSNPDDFTVRFNLGVLLWEKGEGRPELRHEAVEHFMVAAKLNPQNAAAFRYLGHYYTRVSPEPQRALKCYQRAVALNPDDSDAGEAICDLLDEGGKDNLMIAVCREASEKSARAFWAFRRLGYLQAHLKNWSEAIQSLQQAIRGFPTSADLWETLGLAYGRMGMFTAALKSYGRAVDLDNSRIFALVESGNISLMLGSFRKGTEQFQQALIISPHNVSANYGLASAFLGLAEECVNSGAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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