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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005382`

染色体: Chr02 坐标: 74486327-74489228 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005382`
名称	SmilChr02G005382
描述	uncharacterized SmilChr02G005382
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74486327 - 74489228 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009994`
GeneID	`131009994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009994`
原始查询	`SmilChr02G005382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=25.1; qcov=0.764; evalue=6.21e-21; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=26.8; qcov=0.371; evalue=2.57e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793372.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793372.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793372.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793372.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74486403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B50,C34,D6
`Chr2:74486424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:74486527`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C34
`Chr2:74486527`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C34
`Chr2:74486536`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	96	A11,A16,A19,A21,A25,A6,A9,B10,B103,B105,B107,B108,B109,B112,B114,B115,B120,B121,B122,B124,B126,B128,B129,B131,B133,B137,B139,B17,B18,B20,B23,B24,B29,B30,B31,B35,B37,B4,B47,B51,B52,B56,B57,B62,B64,B65,B66,B7,B71,B74,B77,B78,B8,B80,B81,B83,B84,B87,B88,B93,B96,B98,C1,C10,C16,C17,C23,C26,C27,C30,C32,C37,C41,C43,C44,C47,C48,C5,C54,C55,C59,C60,C62,C65,C67,C68,C74,C76,C80,C85,C87,C9,D2,D3,D7,D8
`Chr2:74486542`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	156	A11,A15,A16,A19,A20,A21,A25,A3,A6,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B112,B114,B115,B117,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B131,B137,B139,B14,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B27,B29,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B56,B57,B58,B61,B62,B64,B65,B66,B69,B7,B71,B73,B74,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C15,C16,C17,C21,C23,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C60,C62,C65,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C87,C9,D2,D3,D7,D8
`Chr2:74486577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B128,B20,C60,C67
`Chr2:74486584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:74486707`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A15,A20,B102,B104,B135,B27,B35,B36,B41,B42,B43,B5,B50,B69,B71,B73,B78,B81,C15,C34,C46,C57,C72,C73,C74,C8,C82,C9,D6
`Chr2:74486710`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A15,A20,B102,B104,B135,B27,B35,B36,B41,B42,B43,B5,B50,B69,B71,B73,B78,B81,C15,C34,C46,C57,C72,C73,C74,C8,C82,C9,D6
`Chr2:74486719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D7
`Chr2:74486722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B20,C60,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793372.1

423 aa

212

423

DUF674

PF05056 DUF674 5-146 aa PF05056 DUF674 146-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793372.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	5	146	1.4e-74	252.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793372.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	146	375	1.4e-74	252.3	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937389.1
ATGTCTAGAGATAATACCAAGCTATCTCTCAAAGTCATGTTCAACAAACACAAGTCCAAGGTTCTCTTCGCCGAAGCCAACACAGATTTCGTCGAAATTTTGCTAAGTTTCCTCACATTGCCATTGGGAAAACTCGTCACAAATATTCGAAAACACTACGGAGACGAAGCACCCGCCATCGGAAGCTTGAACACTTTGCACCAAGGCTTAGCTAATCTCGACAGCGCCCATTTCTCCTTGCCAGGAGCCAAGGAGATGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009994
ATGTCTAGAGATAATACCAAGCTATCTCTCAAAGTCATGTTCAACAAACACAAGTCCAAGGTTCTCTTCGCCGAAGCCAACACAGATTTCGTCGAAATTTTGCTAAGTTTCCTCACATTGCCATTGGGAAAACTCGTCACAAATATTCGAAAACACTACGGAGACGAAGCACCCGCCATCGGAAGCTTGAACACTTTGCACCAAGGCTTAGCTAATCTCGACAGCGCCCATTTCTCCTTGCCAGGAGCCAAGGAGATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793372.1
MSRDNTKLSLKVMFNKHKSKVLFAEANTDFVEILLSFLTLPLGKLVTNIRKHYGDEAPAIGSLNTLHQGLANLDSAHFSLPGAKEMLLNPETSFRAECRNLAIDISSSLRERRYYVCEDWECPKSAHKNISLYSDIAKCACGGSLKTVMELLKFSLTSATPLTDVIIKKTQTSFTAATGPETFLPDIQRDDHANPRNLVLQVCLQKSTNKFLFAVATAEFVELLLSFLTVPLGGVEFLLRGNTGLKNIDNLYRSVTNGID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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