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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005385`

染色体: Chr02 坐标: 74501887-74504113 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005385`
名称	SmilChr02G005385
描述	uncharacterized SmilChr02G005385
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74501887 - 74504113 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009364`
GeneID	`131009364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009364`
原始查询	`SmilChr02G005385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09140` (AT3G09140) - identity=28.6; qcov=1.09; evalue=6.01e-47; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.7; qcov=0.792; evalue=7.25e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792642.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792642.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792642.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792642.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792642.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74502041`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A22,B102,B104,B105,B27,B44,B7,B74,B78,B79,C13,C21,C24,C33,C50,C72,C74,C86,D7,D9
`Chr2:74502044`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A22,B102,B104,B105,B27,B44,B7,B74,B78,B79,C13,C21,C24,C33,C50,C72,C74,C86,D7,D9
`Chr2:74502294`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B12,B137,B138,B49,B51,B56,B60,B65,B81,B90,B92,B96,C70,C87,D4,D6
`Chr2:74502420`	`AAG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B22,C24,C3,D1
`Chr2:74502595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B3,C75
`Chr2:74502661`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A3,A9,B1,B10,B122,B123,B132,B25,B31,B38,B39,B41,B52,B65,B71,B78,C21,C45,C49,C6,C75,D11,D5,D7
`Chr2:74502809`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B136,B36
`Chr2:74502809`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B136,B36
`Chr2:74502953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B50,C34,D10,D6
`Chr2:74502975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:74503030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B57
`Chr2:74503045`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A4,B10,B101,B102,B112,B123,B124,B125,B128,B132,B133,B137,B139,B14,B25,B28,B31,B49,B52,B55,B60,B65,B7,B73,B74,B79,B80,B81,B90,B92,C18,C22,C23,C29,C33,C40,C46,C49,C55,C6,C73,C79,C81,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792642.1

461 aa

230

461

DUF674

PF05056 DUF674 6-348 aa PF05056 DUF674 366-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792642.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	348	1.5e-83	281.8	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792642.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	366	453	1.5e-83	281.8	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936659.1
TATATTGCAATCGCCACCGCTTCTCGCTCTCCTGACCGCCACCGGAGCTCGGCCGCGCTCAGCCACCGTCTGCTGCGTTTTTTGTCCGTATCTCATGTTCCAGGGCATCCTAATATCATCATAATCCTCCTTCGTCGAGCTTCAAGCTTCAGTCGCCGATAACCCTAATCCCCATTCCTCTGTGATTAGAATTGCCGAAAATGTCTAATGCTGAAGAAGTAAAGGTCTCACTGAAAGTGATGATGAACAAAGAGAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009364
ATGTCTAATGCTGAAGAAGTAAAGGTCTCACTGAAAGTGATGATGAACAAAGAGAAATCTAAGGTGCTGTATGCAGAATCCGATAGCCATTTTGCAGACATTGTGTTGAGCTTCTTGACTTTGCCGCTGGGAAGGATTGTGAAGGTTCTGGAGAAACACTACGGAGATGATGCACCCACCATTGGAAGCTTACACAATTTGTATCACTGCTTAGCAAATTTTGACAGCTCCCATTTTGTGACGGAGGGTGCTAAGCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792642.1
MSNAEEVKVSLKVMMNKEKSKVLYAESDSHFADIVLSFLTLPLGRIVKVLEKHYGDDAPTIGSLHNLYHCLANFDSSHFVTEGAKQALLYSASSFEAEYRMLKVDISDSPPAEYFFCADCDDNAFRCESIYYDVIDCTFYGNMMIKVVGKIYEADAPSDGVLTKHTSSFLISNDLHLLPKDARFVTTIGILGITATDMDNAESIKVDFGLSEIMKLFKASLTSPTPLSDLILNKTTAQMNNTPVVGSQQNEDKRYYGDVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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