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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005386`

染色体: Chr02 坐标: 74512208-74514485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005386`
名称	SmilChr02G005386
描述	uncharacterized SmilChr02G005386
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74512208 - 74514485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009365`
GeneID	`131009365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009365`
原始查询	`SmilChr02G005386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=30.8; qcov=0.72; evalue=6.07e-43; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=29.9; qcov=0.707; evalue=1.84e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792643.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792643.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792643.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792643.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74512388`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A22,A9,B10,B100,B104,B105,B114,B12,B127,B13,B138,B18,B21,B28,B3,B41,B50,B65,C18,C29,C33,C42,C5,C53,C6,C83,C84,C86,D5,D9
`Chr2:74512392`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B33,C80
`Chr2:74512392`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B33,C80
`Chr2:74512411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C12
`Chr2:74512438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B24,C18
`Chr2:74512643`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C18,C29
`Chr2:74512643`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C18,C29
`Chr2:74512647`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C18,C29
`Chr2:74512647`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C18,C29
`Chr2:74512668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B20,C55
`Chr2:74512690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:74512698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792643.1

460 aa

230

460

DUF674

PF05056 DUF674 6-334 aa PF05056 DUF674 376-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792643.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	334	1.1e-85	288.9	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792643.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	376	454	1.1e-85	288.9	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936660.1
TCCAACTTCCAAGCTTTCAGAGCAAGCTTGAAGCGCCGACCATTGTTTACTGTTCAAATCTTTCAGAGCAAGCTTGAAGCGCCGACCATAGTTTATTCCACTCGCCACCGAAGCTCCGCCGCGCTCAGCCACCGTCTGCTGCGTTTTTTCTCCGTATCTCAGGCTCCGCGCCATCCTATTTTCATAAAAAACCTCCGTTGTCGAGCTTCAGTCGCCGATAACCCTAATCCCCTTTGCTCTGTGATTTGAATAGCCGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009365
ATGTCTGATGCTGAAGAAGTAAAGGTCTCACTGAAAGTGATGATGAACAGACAAAAATCCAAGGTGCTATTTGCAGAATCCGACAGCGATTTTGCAGACATTGTGTTGAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTGAAAGTTCTGGAGAAACACTACGGAGATGAGGCACCCACCATTGGAAGCTTAAACAATTTGTACCACACCTTAGCAAACCTTGACAGCTCCCATTTTGTGACGGAGGGTGCTAAGCAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792643.1
MSDAEEVKVSLKVMMNRQKSKVLFAESDSDFADIVLSFLTLPLGRIVKVLEKHYGDEAPTIGSLNNLYHTLANLDSSHFVTEGAKQTLLDSASSFEAEYRMLKVDISDSPPAEYFVCSNCSSKRFRCASIYYDSISCSNCKDRMSKVVDTSDAPSDGLFTKHTSSFIVSNDLHILPKETGFLTTVRILGITVRDMENAETIKVDFGFTEIMKLLKASLTSPTPLSDLILNKTTTAEMNNTPVYTPVVGSQRNQYTRYIGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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