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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005392`

染色体: Chr02 坐标: 74532819-74535071 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005392`
名称	SmilChr02G005392
描述	uncharacterized SmilChr02G005392
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74532819 - 74535071 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009998`
GeneID	`131009998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009998`
原始查询	`SmilChr02G005392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=29.7; qcov=1.01; evalue=1.2e-51; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=28.7; qcov=0.813; evalue=8.64e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793376.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793376.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793376.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793376.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74532834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:74532848`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A11,A16,A19,A20,A22,A23,A5,A9,B10,B107,B109,B119,B12,B122,B126,B131,B139,B16,B17,B2,B21,B26,B30,B31,B39,B45,B47,B49,B5,B6,B62,B64,B69,B72,B78,B79,B82,B83,B84,B85,B88,B98,C10,C14,C18,C2,C25,C26,C29,C31,C33,C36,C40,C41,C43,C44,C45,C49,C55,C57,C59,C6,C61,C66,C68,C7,C72,C73,C75,C77,C79,C83,C85,C86,D11,D2,D5
`Chr2:74532851`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A11,A16,A19,A20,A22,A23,A5,A9,B10,B107,B109,B111,B119,B12,B122,B126,B131,B139,B16,B17,B2,B21,B23,B24,B25,B26,B30,B31,B39,B45,B47,B49,B5,B6,B62,B64,B69,B72,B78,B79,B82,B83,B84,B85,B88,B98,C10,C18,C2,C25,C26,C29,C31,C33,C36,C40,C41,C43,C44,C45,C49,C55,C57,C59,C6,C61,C66,C68,C7,C72,C73,C75,C77,C79,C83,C85,C86,D11,D2,D5
`Chr2:74532856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr2:74533015`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C70,C87
`Chr2:74533015`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C70,C87
`Chr2:74533030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B57,C13,C42
`Chr2:74533036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C81
`Chr2:74533043`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr2:74533043`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr2:74533165`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B59,B98,C82
`Chr2:74533165`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B59,B98,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793376.1

454 aa

227

454

DUF674

PF05056 DUF674 4-359 aa PF05056 DUF674 382-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793376.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	4	359	2.3e-94	317.5	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057793376.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	382	453	2.3e-94	317.5	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937393.1
ATGGATATCAAGCTTTCATTCAAAGCTATGGTGAATAAAAAGAAAGGTAAGGTTCTATTTGTAGAAGTTGACAGCAGCATTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTCCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGGAGCACTACGAAGATGATGAATCTACATCTTATGGAAGCCTGAGCTCTCTCTACAACGGTTTATCAAATCTTGACGGTCACCATTTTTGGACAAAAGGTGCTAAGTCGATTCTGCTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009998
ATGGATATCAAGCTTTCATTCAAAGCTATGGTGAATAAAAAGAAAGGTAAGGTTCTATTTGTAGAAGTTGACAGCAGCATTGCAGATGTGTTGCTAAGCTTCCTCACATTGCCACTCGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGGAGCACTACGAAGATGATGAATCTACATCTTATGGAAGCCTGAGCTCTCTCTACAACGGTTTATCAAATCTTGACGGTCACCATTTTTGGACAAAAGGTGCTAAGTCGATTCTGCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793376.1
MDIKLSFKAMVNKKKGKVLFVEVDSSIADVLLSFLTLPLGTIVRILKEHYEDDESTSYGSLSSLYNGLSNLDGHHFWTKGAKSILLHPRRSSSDAECIKLMLDVSDSPPLEYYICPNKCNNRFQITSMYYDNAGKCRCCNRHRMKREVAENDAQIVPCCDGVFTKTTASFVITDDLQIMPNAGLLQIVSVLGVTDMDEVETINITFGLFEVVELLEASLISTNPLSVVILDEEVLEMSSTEGKYEDQSPSTAANALISNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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