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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005405`

染色体: Chr02 坐标: 74579314-74582965 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005405`
名称	SmilChr02G005405
描述	uncharacterized SmilChr02G005405
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74579314 - 74582965 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009375`
GeneID	`131009375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009375`
原始查询	`SmilChr02G005405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=32.5; qcov=0.677; evalue=3.15e-48; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=28; qcov=0.778; evalue=3.57e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792660.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792660.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792660.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792660.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792660.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74580186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:74580310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:74580376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:74580498`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A11,A19,A20,A6,A7,B109,B117,B121,B40,B47,B51,B55,B77,B83,B84,B87,B88,C10,C13,C56,C59,C64,C66,C77,C8,C83,C87,D11,D9
`Chr2:74580500`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A11,A19,A20,A6,A7,B109,B117,B121,B40,B47,B51,B55,B77,B83,B84,B87,B88,C10,C13,C56,C59,C64,C66,C77,C8,C83,C87,D11,D9
`Chr2:74580606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B65,C71
`Chr2:74580631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B24,B53,C14,C18
`Chr2:74580642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B33,B65,D1
`Chr2:74580661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,D2,D8
`Chr2:74580824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:74580828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:74580838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792660.1

468 aa

234

468

DUF674

PF05056 DUF674 6-431 aa

XP_057792661.1

468 aa

234

468

DUF674

PF05056 DUF674 6-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792660.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	431	2.6e-94	317.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792661.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	431	2.6e-94	317.3	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936678.1
GCAAAGATTCGCCAATGGCATAGCTCAACTGTTTGCTCCATTTTGCTTTAGTAGCCAAATAATGCCAGTGCTTCTCTCTCACTCATCTATCCACTCCTCTCTTCACTTTTAGCCGCTCAAAACCACCGTCGCAGCCACCCTTCCTCCGCCGCGAGCTCAGCCACCCTCATCCAACAACATATTTTCTTCTGGGTTGACTTGAAAATCTGTCCTTTTCTCTGAAAATCCCCAATTATATAGATTGGAAATCAGGACCTCGA...

XM_057936677.1
GCAAAGATTCGCCAATGGCATAGCTCAACTGTTTGCTCCATTTTGCTTTAGTAGCCAAATAATGCCAGTGCTTCTCTCTCACTCATCTATCCACTCCTCTCTTCACTTTTAGCCGCTCAAAACCACCGTCGCAGCCACCCTTCCTCCGCCGCGAGCTCAGCCACCCTCATCCAACAACATATTTTCTTCTGGGTTGACTTGAAAATCTGTCCTTTTCTCTGAAAATCCCCAATTATATAGATTGGAAATCAGGACCTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009375
ATGGATGATGCTAAAGATGCAGAGTTCTCATTGAAAGTGATGATAAATAAAAAGAAAACTAAGGTACTCTTTGTAGAAGCTGACAGCCATTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTATCAAAGTCCTTGAGAAGCACTATGGAGACGAGGCACCTATCATTGGTAGCTTAAGCAGTTTGTACCATAGCTTAGTGGATCTTGATATCACCTGTTTCTGGACAGAGGGTGCCAAGCAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792660.1
MDDAKDAEFSLKVMINKKKTKVLFVEADSHFADILLSFLTLPLGRIIKVLEKHYGDEAPIIGSLSSLYHSLVDLDITCFWTEGAKQTLLNPASSFEDEYARLKLDYNDYHPAKYFTCRYLSSHSIRSVSMYHDSAPMCLRCEYMHQRIIKQDEKECQFASEDGVFTINTTPFIISDDLQIFPNKIGLLGIISILGLTDADKAQPINVTFGFSEIMSLLKASLISQTPFSDLILSKARHVNSVAVGSEPETSVNQIKNEDN...

XP_057792661.1
MDDAKDAEFSLKVMINKKKTKVLFVEADSHFADILLSFLTLPLGRIIKVLEKHYGDEAPIIGSLSSLYHSLVDLDITCFWTEGAKQTLLNPASSFEDEYARLKLDYNDYHPAKYFTCRYLSSHSIRSVSMYHDSAPMCLRCEYMHQRIIKQDEKECQFASEDGVFTINTTPFIISDDLQIFPNKIGLLGIISILGLTDADKAQPINVTFGFSEIMSLLKASLISQTPFSDLILSKARHVNSVAVGSEPETSVNQIKNEDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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