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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005408`

染色体: Chr02 坐标: 74592195-74595504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005408`
名称	SmilChr02G005408
描述	uncharacterized SmilChr02G005408
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74592195 - 74595504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009377`
GeneID	`131009377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009377`
原始查询	`SmilChr02G005408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=34.2; qcov=0.691; evalue=2.33e-47; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=28.7; qcov=0.785; evalue=6.06e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792667.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792667.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792667.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792667.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74593861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C18
`Chr2:74593863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:74593920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B26,C18
`Chr2:74593982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B54
`Chr2:74594044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C23,D10
`Chr2:74594045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:74594138`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A13,A18,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A9,B107,B111,B113,B12,B120,B121,B122,B129,B135,B136,B15,B18,B21,B23,B26,B28,B33,B34,B48,B56,B63,B68,B71,B72,B73,B75,B78,B85,B89,B91,B96,C16,C17,C24,C25,C30,C34,C36,C37,C48,C5,C50,C51,C54,C59,C62,C65,C67,C74,C77,C80,C83,C84,C85,C9,D2,D3
`Chr2:74594142`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A13,A18,A23,A24,A25,A4,A5,A9,B107,B111,B113,B12,B120,B121,B135,B136,B15,B21,B23,B26,B48,B68,B72,B89,B91,B96,C16,C17,C24,C30,C34,C36,C37,C5,C50,C51,C54,C59,C65,C67,C74,C84,C85,C9,D3
`Chr2:74594144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A2,A7,B10,B101,B103,B108,B120,B125,B128,B133,B134,B138,B20,B22,B40,B44,B46,B54,B59,B6,B61,B76,B8,B83,B87,B93,B94,B95,B98,B99,C23,C38,C4,C58,C63,C67,C70,C72,C76,C87,D1,D9
`Chr2:74594287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B95
`Chr2:74594298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:74594315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792667.1

466 aa

233

466

DUF674

PF05056 DUF674 6-431 aa PF05056 DUF674 383-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792667.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	431	6.7e-92	309.4	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792667.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	383	460	6.7e-92	309.4	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936684.1
AGTACTTTTTGTGAAACCGACAAACCAAAAACATGGAAAAGAAAAAGTTGAAAAACAGAAAAAGAAGTTAAAAAAAAGTAAAAAAGCAAAGATTCGCCAATGGAATAGCTCAACTGTTTGCTCCATTTTGCTTTAGTAGCCAAATAATGCAAGTGCTTCTCTCTCACTCATCTATCCACTCCTCTCTTCACTTTTAGCCGCTCAAAACCACCGTCGCAGCCACCCTTCCTCCGCCGCGAGCTCAGCCACCCTCATCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009377
ATGGATGATGCTAAAGATGCAGAGTTCTCATTGAAAGTGATGATAAATAAAGAGAAAACTAGGGTACTCTTTGCACAAGCTGACAGCCATTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTGAAAGTCCTCGAGAAGCACTATGGATCAGTTGAGGCACCCACCATTGGAAGCTTAAGCAATTTGTACCGAAGCGTAGCAAATCTTGAAGTTGGCTCCCATTTTGTGACTGAGGGTGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792667.1
MDDAKDAEFSLKVMINKEKTRVLFAQADSHFADILLSFLTLPLGRIVKVLEKHYGSVEAPTIGSLSNLYRSVANLEVGSHFVTEGAKQALLNPTSSFEDKYAGLKLDITDFQPAQYFSCSVHSKRFRSVSIYYDTTRSTCPSWDCDRKLKKVVDEKGPKATSTDEVFTVHKASFIISDDLQILPNETGIVGIVVSLGITDMDKAELINVDLGFNEIMNLLMTSLTSPTPLSDVILNKTRQINTSILESPPLLQNVAMEEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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