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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005409`

染色体: Chr02 坐标: 74595786-74597284 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005409`
名称	SmilChr02G005409
描述	uncharacterized SmilChr02G005409
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74595786 - 74597284 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010009`
GeneID	`131010009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010009`
原始查询	`SmilChr02G005409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=31.8; qcov=0.745; evalue=6.71e-42; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.6; qcov=0.84; evalue=1.53e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793387.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793387.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793387.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793387.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74595874`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B105,B31,B54,C1,D11,D8
`Chr2:74595909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C14
`Chr2:74595910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C1,D8
`Chr2:74595933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C14
`Chr2:74595992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:74596011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr2:74596015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B139,C46,C49
`Chr2:74596031`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	71	A18,A2,A23,A3,A4,A5,A9,B101,B103,B104,B111,B113,B119,B12,B122,B129,B131,B135,B136,B139,B18,B2,B21,B23,B27,B30,B34,B35,B38,B40,B41,B44,B46,B57,B62,B64,B68,B70,B71,B72,B75,B78,B85,B89,B91,B99,C15,C19,C25,C35,C36,C37,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C54,C59,C61,C62,C65,C67,C72,C74,C77,C83,C84,D2
`Chr2:74596036`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	67	A18,A2,A23,A3,A4,A5,A9,B101,B103,B104,B111,B113,B119,B12,B122,B129,B131,B135,B136,B139,B18,B2,B21,B23,B27,B30,B34,B35,B38,B40,B44,B46,B57,B62,B64,B68,B71,B75,B78,B85,B89,B91,B99,C15,C19,C25,C35,C36,C37,C46,C47,C48,C50,C51,C52,C54,C59,C61,C62,C65,C67,C72,C74,C77,C83,C84,D2
`Chr2:74596053`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B139,C46
`Chr2:74596053`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B139,C46
`Chr2:74596073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793387.1

431 aa

216

431

DUF674

PF05056 DUF674 8-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793387.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	420	8.3e-84	282.7	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937404.1
ATGTCTGATGTTGAGAAGGATGTCAAGTTGTCATTGAAAGTGATGATAAATAAAGAGAGAAATGAGGTACTCTTTGCAGAAGCCGACAACCATTTCACAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTTTCAAAGTCTTCAAGAAGCACTATGGCGATGAGCTTCCTACCATTGCAAGCTTAAGCAGTTTGTACCATAGCTTAACGAATCTTGATAGCGCCCATTTTGTGACGGAGGGTGCTAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010009
ATGTCTGATGTTGAGAAGGATGTCAAGTTGTCATTGAAAGTGATGATAAATAAAGAGAGAAATGAGGTACTCTTTGCAGAAGCCGACAACCATTTCACAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTTTCAAAGTCTTCAAGAAGCACTATGGCGATGAGCTTCCTACCATTGCAAGCTTAAGCAGTTTGTACCATAGCTTAACGAATCTTGATAGCGCCCATTTTGTGACGGAGGGTGCTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793387.1
MSDVEKDVKLSLKVMINKERNEVLFAEADNHFTDILLSFLTLPLGRIFKVFKKHYGDELPTIASLSSLYHSLTNLDSAHFVTEGAKQILLSPASLFEDEYKRLKLDITDSPPAEYFYCSGRAPHGRLHIVSMYYDSVERCILCHRTMKKEVAKKGSEADSSSDGVLTIRKASFTISDDLHIFPNEIGLLPIITLLGITDAHKAEEIKVDLGFNEACMTSPTPLSDVILNKTTHLKSAEVPLHEMVVKEENLNTMSLKVTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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