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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005410`

染色体: Chr02 坐标: 74597924-74598825 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005410`
名称	SmilChr02G005410
描述	uncharacterized SmilChr02G005410
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74597924 - 74598825 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010011`
GeneID	`131010011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010011`
原始查询	`SmilChr02G005410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01150; symbol=AT5G01150; hit=AT5G01150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01150; symbol=AT5G01150; hit=AT5G01150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01150` (AT5G01150) - identity=31.4; qcov=0.946; evalue=2.8e-28; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=34.3; qcov=0.891; evalue=4.86e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793388.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793388.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793388.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793388.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74597935`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B3,D10
`Chr2:74597935`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B3,D10
`Chr2:74598052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:74598095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:74598097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B59,B96
`Chr2:74598168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,A7,B40
`Chr2:74598194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,D10
`Chr2:74598224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:74598225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B59,B6,C63
`Chr2:74598286`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A10,B80
`Chr2:74598286`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A10,B80
`Chr2:74598287`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A10,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793388.1

239 aa

120

239

DUF674

PF05056 DUF674 8-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793388.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	217	1.4e-48	166.6	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937405.1
ATGGCTGATGATAAAAAGGGTGCTACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTTGCAGACTCCGACAGCCACTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTCAAAATCCTCGACCACCACTATGGAGACGAGCCGCCTTCCGTTGGTAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGCAAATCTCGACGGTGCCTATTTCTGGACTGATGGAGCTAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010011
ATGGCTGATGATAAAAAGGGTGCTACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTATTCTTTGCAGACTCCGACAGCCACTTCGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAATTGTCAAAATCCTCGACCACCACTATGGAGACGAGCCGCCTTCCGTTGGTAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGCAAATCTCGACGGTGCCTATTTCTGGACTGATGGAGCTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793388.1
MADDKKGATFSLKVMINKERTKVFFADSDSHFADILLSFLTLPLGRIVKILDHHYGDEPPSVGSLSSLYRSLANLDGAYFWTDGAKQTLLDPTSSFEDECGRLKLDITYYQPAKYFCCSEYIYENYHDRFRSVSIYYDHVKRCKVCLLDILNEVVKKGSEATASREGVFTMNTSSFIISDDLHIFPSETGLLEIISFLGITDMDNAEQIKVDLGFNELDYEFVEGILDVPNSIVGHHPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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