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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005429`

染色体: Chr02 坐标: 74729962-74733133 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005429`
名称	SmilChr02G005429
描述	uncharacterized SmilChr02G005429
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74729962 - 74733133 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009389`
GeneID	`131009389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009389`
原始查询	`SmilChr02G005429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=26.9; qcov=1.12; evalue=1.67e-32; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.6; qcov=0.833; evalue=5.75e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792676.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792676.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792676.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792676.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74730239`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B10,B104,B105,B17,B22,B38,B51,B76,B90,C14,C3,C36,C40,C5,C53,C64,C65,C78,C87,D3,D9
`Chr2:74730433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr2:74730940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:74730942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B13
`Chr2:74730958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:74730977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:74730980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C46,C48,D2
`Chr2:74731014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	157	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A19,A20,A22,A24,A25,A3,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B115,B117,B12,B120,B121,B122,B123,B127,B128,B130,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B44,B45,B48,B50,B51,B53,B55,B56,B59,B6,B61,B65,B68,B7,B71,B72,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B86,B88,B90,B93,B94,B96,B97,B98,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C42,C44,C49,C5,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D8,D9
`Chr2:74731063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C54,D7
`Chr2:74731114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B24,B42,B43
`Chr2:74731154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B60,C80
`Chr2:74731233`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	B23,B29,B37,B44,B48,B52,C17,C18,C25,C3,C37,C38,C53,C6,C69,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792676.1

413 aa

206

413

DUF674

PF05056 DUF674 12-116 aa PF05056 DUF674 123-292 aa PF05056 DUF674 315-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792676.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	12	116	6e-71	240.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792676.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	123	292	6e-71	240.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792676.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	315	405	6e-71	240.3	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936693.1
TTATATTTAAAATTTCAACTTTCGATTTTTTAAAAAAGATATTTCATTATGCAGAATTCAGTTACGGAATAAGGGTTGATCTCGCCAAATTCTTGTTGACAAAAATGAAATGATTTTAGACAAAATAGAAAGAAAAAAAAAATGCCAAACGTCATTAAAATTGATAAGACACCTGAAAAGGGCAAAAGAAGAAAAATTGGCTGATATTTTATTTTGTTTCCTGCCCTTCGGAGCCCTTCGACTTCTTCGTGGAATGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009389
ATGTCTGAGGCTGAGGCTGAGGCTGAGGCTGCGGAGGTGAAGTTACATGTCAAGGTTGTGACGAATAAGGAGAAGACGAAGGTACTATTTGCAGAAGCTGGCAGCGATTTCACAGACGTGTTGTTAAGCTTCCTACTTTTGCCATTGGGAGCAATCGTGAATGTCCTCGAGAAGCACTACGGAGACGAGGCACCTGTTATTGGAAGCTTGAACACTCTTTACAATGGTGTAGCAAATCTTGATATCATCCATTTCCGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792676.1
MSEAEAEAEAAEVKLHVKVVTNKEKTKVLFAEAGSDFTDVLLSFLLLPLGAIVNVLEKHYGDEAPVIGSLNTLYNGVANLDIIHFRSAAYKEKLRNPSCCLRLMHRLRLNVNLTQPPSFKPRNPYDGVFTEGEASFLISDDLHVWPNAGGSIAKTLSTLGISATDVEGVETRDMTFGLNEIMALLKESLISSNPLTALVFPGRRMILATEGHILLRESDQSPKMILQVMLEKSTKKLVFAQADCDFIDFLFRMLTFFVGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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