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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005449`

染色体: Chr02 坐标: 74843521-74846635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005449`
名称	SmilChr02G005449
描述	chromatin remodeling protein EBS-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74843521 - 74846635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009411`
GeneID	`131009411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009411`
原始查询	`SmilChr02G005449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chromatin remodeling protein EBS-like
产物	chromatin remodeling protein EBS-like
Arabidopsis	`AT4G22140` (EBS) PHD finger family protein / bromo-adjacent homology (BAH) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828303] identity=80.4; qcov=1.04; evalue=7.87e-137; confidence=high
Rice	`Os09g0386500` - identity=79.2; qcov=1; evalue=1.04e-133; confidence=high
GO	GO:0003682 (chromatin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF01426 (BAH); PF30811 (PHD_UBR7-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792707.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057792707.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057792708.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057792708.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74843792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B1,B122,B44,C58
`Chr2:74844279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:74844301`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A1,A10,A13,A14,A19,A2,A24,A4,A6,A7,B1,B101,B106,B110,B115,B131,B132,B135,B137,B16,B22,B37,B4,B40,B44,B66,B74,B80,B89,B99,C21,C24,C31,C32,C38,C47,C49,C50,C63,C65,C68,C70,C72,C75,C82,D1,D4,D6
`Chr2:74844310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C85
`Chr2:74844327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C48,C59,D2
`Chr2:74844340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:74846274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792707.1

237 aa

118

237

BAH

PHD_UBR7-like

PHD

PF01426 BAH 23-134 aa PF30811 PHD_UBR7-like 139-188 aa PF00628 PHD 141-186 aa

XP_057792708.1

216 aa

108

216

BAH

PHD_UBR7-like

PHD

PF01426 BAH 23-134 aa PF30811 PHD_UBR7-like 139-188 aa PF00628 PHD 141-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792707.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	23	134	4.4e-23	82.2	BAH domain
`XP_057792707.1`	Pfam	`PF30811`	PHD_UBR7-like	Domain	139	188	6.9e-10	39.5	UBR7-like PHD finger
`XP_057792707.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	141	186	1.2e-08	35.6	PHD-finger
`XP_057792708.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	23	134	3.5e-23	82.5	BAH domain
`XP_057792708.1`	Pfam	`PF30811`	PHD_UBR7-like	Domain	139	188	6.2e-10	39.6	UBR7-like PHD finger
`XP_057792708.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	141	186	8.6e-09	36.0	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936725.1
ATGTAGTCAAATTCTTAAAAGAAGGCTTCAACAATTATTTTGATAAGCAATCTCGTAAAATAGTGACACAAAAAAAGTCATAAAAAAAATTAAAATGAGAAAAAATAGAAAAAAGAAGAAGGGGACGGCCAGGGGCAGACTGAACTCCAACCAGTGTTTCTTCACCAAATTCCTCCACCCCTCTCTCTCTCCTCGAATCCAGTTTCTAGGGTTTCTGCTTCTCTATCTAAATTCCTGCATACCGGAGTCAAATTCATCTG...

XM_057936724.1
ATCTCGTAAAATAGTGACACAAAAAAAGTCATAAAAAAAATTAAAATGAGAAAAAATAGAAAAAAGAAGAAGGGGACGGCCAGGGGCAGACTGAACTCCAACCAGTGTTTCTTCACCAAATTCCTCCACCCCTCTCTCTCTCCTCGAATCCAGTTTCTAGGGTTTCTGCTTCTCTATCTAAATTCCTGCATACCGGAGTCAAATTCATCTGCAACTCGGGGGTGACGATTAATTATTATAATCTTTTTATTTGGCTGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009411
ATGGCGAAGACGAAGCCCGGAAAAAAGGACCTCGATTCTTACAATATCAAGGGCACCAACAAAGTCGTGAGACCGGGAGATTGTGTGTTAATGAGACCATCTGACTCAGACAAGGCCCCGTACGTGGCCAAAGTGGAGAATATCGAAGCTGACCATAGGAACAATGTGAAAGTACGTGTGAGGTGGTACTACCGCCCTGAGGAATCCATCGGGGGTCGCAGGCAGTTCCATGGTGCAAAGGAGCTCTTCTTGTCCGATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792707.1
MAKTKPGKKDLDSYNIKGTNKVVRPGDCVLMRPSDSDKAPYVAKVENIEADHRNNVKVRVRWYYRPEESIGGRRQFHGAKELFLSDHFDVQSAHTIEGKCIVHSFKNYTKLENVGTEDYFCRFEYKAATGGFTPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMVQCEGCKDWFHPSCMGMAIEEAKKLDHFLCSDCSSDDDAKRSLNSFPVSTADEGKVRDASPFSNMFIIRQWSCDYLDLFCSIWV

XP_057792708.1
MAKTKPGKKDLDSYNIKGTNKVVRPGDCVLMRPSDSDKAPYVAKVENIEADHRNNVKVRVRWYYRPEESIGGRRQFHGAKELFLSDHFDVQSAHTIEGKCIVHSFKNYTKLENVGTEDYFCRFEYKAATGGFTPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMVQCEGCKDWFHPSCMGMAIEEAKKLDHFLCSDCSSDDDAKRSLNSFPVSTADEGKVEPKRRKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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