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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005450`

染色体: Chr02 坐标: 74848273-74851389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005450`
名称	SmilChr02G005450
描述	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74848273 - 74851389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009412`
GeneID	`131009412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009412`
原始查询	`SmilChr02G005450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
产物	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
Arabidopsis	`AT2G05810` (AT2G05810) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815132] identity=56.2; qcov=0.943; evalue=4.08e-178; confidence=high
Rice	`Os09g0135800` - identity=46.8; qcov=0.96; evalue=4.15e-134; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF23005 (DUF7032)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057792709.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057792709.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792709.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792709.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74849432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:74849461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:74849488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:74849500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:74849511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:74849520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:74849530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C46
`Chr2:74849533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:74849535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C28
`Chr2:74849575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B66,B88,C48,D2
`Chr2:74849576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:74849589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792709.1

574 aa

287

574

DUF7032

Arm

PF23005 DUF7032 24-134 aa PF00514 Arm 273-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792709.1`	Pfam	`PF23005`	DUF7032	Domain	24	134	2.5e-29	102.1	Domain of unknown function (DUF7032)
`XP_057792709.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	273	311	2e-16	60.1	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936726.1
CCAAAATATAAATTTCATTAAATGTGACAAAAAAAATACTATAAAATGCTCTTCCTCTTTAGCCCATTTCTAACACCTCTTTTTTTCACACACAACACACACTGCGACGGCGCCCACCACCCCTCCTTCCTCTATTATTTCACATGCATTTTCTGACTTTTTCGAGCATAATATAATATACTGAATCACACACACTCGTAAACATCACAAAAGCAGAAAATTAATAAATAAATAAATAGAAAAAAGAAAAAAAGCAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009412
ATGCCTCCCGCCACCGTCCCGCCACCGCAATCCACAGCGGCGCCACCGTCCCCTGCCGAGACTCTCCGCCAAATTTCTGTCCTCCTCGCCGACCTCCTCCCGTCCACCCTCGCCGTCACCTCCTTCGCCGCGCGGTGGCAAGTGCTCCGCTCGAAGCTCGCCGCCGTCCAAACCCTCACCGCCGAAATCTCCGACTCCCCGCACTGGTCGGACAATCCGCTCCTTCCGCCGCTCCTCCCGGCGCTGCTATCCACCCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792709.1
MPPATVPPPQSTAAPPSPAETLRQISVLLADLLPSTLAVTSFAARWQVLRSKLAAVQTLTAEISDSPHWSDNPLLPPLLPALLSTLRRTEILCHHCRGAAAGRGKLLMQSDLDMAAGWLSKQISDLELLLRSGVLHHSTAIVLSRPDPTSSKEELTFFVRDLFARLQIGGLEFKLKALDSLIQLLIEDSKSAMIVAREGDMRCLTSLLDSSGDDSVRELAVHAVSLLVAAGDLPRKCVFEEGALGPLLRIIECSSVQVKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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