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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005469`

染色体: Chr02 坐标: 74969993-74970778 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005469`
名称	SmilChr02G005469
描述	36.4 kDa proline-rich protein-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74969993 - 74970778 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009431`
GeneID	`131009431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009431`
原始查询	`SmilChr02G005469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	36.4 kDa proline-rich protein-like
产物	36.4 kDa proline-rich protein-like
Arabidopsis	`AT3G22142` (AT3G22142) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008021] identity=62; qcov=0.699; evalue=2.15e-44; confidence=medium
Rice	`Os06g0168700` - identity=65.5; qcov=0.444; evalue=1.82e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057792732.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057792732.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792732.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792732.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74970174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr2:74970234`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A7,B103,B124,B15,B19,B3,B87,C10,C41,C43,C52,C60,C70
`Chr2:74970387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:74970389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:74970478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B105,B47,B67
`Chr2:74970491`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C5
`Chr2:74970491`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C5
`Chr2:74970520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr2:74970636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C23,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792732.1

196 aa

196

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

Hydrophob_seed

PF14368 LTP_2 103-194 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 113-194 aa PF14547 Hydrophob_seed 113-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792732.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	103	194	5e-08	33.7	Probable lipid transfer
`XP_057792732.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	113	194	2.2e-14	54.2	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057792732.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	113	195	2.7e-27	95.7	Hydrophobic seed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936749.1
CAACTATCATAGTAGGCAACAACATCTTCAACATGGGCAACTATAATATTGCTCAACTCATAATATTTCTCAATTTAGGAACTCTTCTTATTTCTCAAGCATCATGTCCATCTTGTGGCCCCACTCCTCCAACTAAGCCACCACCAAAGGTGAAACCACCGAAACCGTGTCCACCAACGGCGCCATCACCCCCGAAATCGTCACCACCGACGAAATTACCTCCACCGACGAAATCACCCCCGAAATCGTCACCACCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009431
ATGGGCAACTATAATATTGCTCAACTCATAATATTTCTCAATTTAGGAACTCTTCTTATTTCTCAAGCATCATGTCCATCTTGTGGCCCCACTCCTCCAACTAAGCCACCACCAAAGGTGAAACCACCGAAACCGTGTCCACCAACGGCGCCATCACCCCCGAAATCGTCACCACCGACGAAATTACCTCCACCGACGAAATCACCCCCGAAATCGTCACCACCGACGAAATCACCTCCACCGACGAAATCACCCCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792732.1
MGNYNIAQLIIFLNLGTLLISQASCPSCGPTPPTKPPPKVKPPKPCPPTAPSPPKSSPPTKLPPPTKSPPKSSPPTKSPPPTKSPPKSSPPTKSPPPTKSPPMASPPKAPDACPIDVLKLGACVDVLNGLVHIGIGPSAKDECCTVLEGVAGLDAALCLCTTIKAKLLNINILLPIALQVLVDCGKNPPSGFQCPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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