当前解析结果
SmilChr02G005473| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005473 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005473 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 71E1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 74987706 - 74989538 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009436 |
|---|---|
| GeneID | 131009436 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009436 |
| 原始查询 | SmilChr02G005473 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 71E1-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 71E1-like |
| Arabidopsis | AT3G21760 (HYR1)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821730] identity=45; qcov=1.02; evalue=1.43e-129; confidence=medium |
| Rice | Os07g0564100 (OJ1112_E08.105)- identity=37.1; qcov=1.01; evalue=9.04e-86; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009436 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057792738.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057792738.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792738.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792738.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792738.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:74987995 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B115,B134,B26,C22 |
Chr2:74988041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B31,B92,C1,C32,C68 |
Chr2:74988043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:74988153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A7,B60,C11,C69 |
Chr2:74988173 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:74988178 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,B78,C49 |
Chr2:74988185 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr2:74988191 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B56,B96,D9 |
Chr2:74988205 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B23,B66,B78,C49,C58 |
Chr2:74988317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:74988352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr2:74988367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B25 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792738.1PF00201
UDPGT 255-396 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792738.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 255 | 396 | 1.3e-20 | 74.5 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。