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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005475`

染色体: Chr02 坐标: 74994823-74996411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005475`
名称	SmilChr02G005475
描述	putative UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74994823 - 74996411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009438`
GeneID	`131009438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009438`
原始查询	`SmilChr02G005475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 3
产物	putative UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 3
Arabidopsis	`AT3G21790` (AT3G21790) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821733] identity=43.3; qcov=1.05; evalue=7.39e-119; confidence=medium
Rice	`Os07g0564100` (OJ1112_E08.105) - identity=39.1; qcov=1.04; evalue=3.02e-87; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00201 (UDPGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792741.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792741.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792741.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792741.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74995017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B8
`Chr2:74995025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B58,C60
`Chr2:74995156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B25,B4
`Chr2:74995159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B4
`Chr2:74995181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B25,B4
`Chr2:74995199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:74995341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B25,B4
`Chr2:74995342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr2:74995387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr2:74995401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B88,B9,C40,C5
`Chr2:74995447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B24,B74
`Chr2:74995529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792741.1

461 aa

230

461

UDPGT

PF00201 UDPGT 253-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792741.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	253	380	7.5e-21	75.2	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936758.1
GGGCCGGCCCGAGAGATACAGGATCGACTAGGCCTATATATAGTTGAGAATTTGTAACACATGCAATTGATCACATAGATTGGGTTTCTCATTTCTCCAAAAATGGAAACGAAGAGAGCCGAACTCGTATTCATCCCCTCTCCGGGGCTGAGCCACCTCGTCTCCACCGTGGAGACGGCCAAGCTCCTCCTCCGCCGCCACCGCCGCCTCGCCGCCACCGTGCTCCTCATCCCAAACCCCCGGCCCACCGACGCCTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009438
ATGGAAACGAAGAGAGCCGAACTCGTATTCATCCCCTCTCCGGGGCTGAGCCACCTCGTCTCCACCGTGGAGACGGCCAAGCTCCTCCTCCGCCGCCACCGCCGCCTCGCCGCCACCGTGCTCCTCATCCCAAACCCCCGGCCCACCGACGCCTACATACAAAACAACTCCTCTCTCACTTCATCATCTCGCCTCCGATTCATTAATCTCCCCGAATTAAAACAACCACAACCGCACAACCATTTCTTCTTCGATACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792741.1
METKRAELVFIPSPGLSHLVSTVETAKLLLRRHRRLAATVLLIPNPRPTDAYIQNNSSLTSSSRLRFINLPELKQPQPHNHFFFDTIDNQISNVKEAVSNLMKHSNSQVAGLVLDIFCTKFVDVAAELRLPSYLFFTASAATLGLFQHLVSLEREDRLARLGSSDAELEVPSFSVPVPARVLPAVFVDENLKPDVFLYCFSRVSEMKGIMVNTFYELETHAVEALLSDPNTPDIYPVGPALDVDGGGGVLDDDVKKWLDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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