当前解析结果
SmilChr02G005479| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005479 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005479 |
| 描述 | anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 75007221 - 75009530 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009454 |
|---|---|
| GeneID | 131009454 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009454 |
| 原始查询 | SmilChr02G005479 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 2-like |
| 产物 | anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase 2-like |
| Arabidopsis | AT3G21800 (UGT71B8)UDP-glucosyl transferase 71B8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821734] identity=40.8; qcov=1.04; evalue=1.36e-116; confidence=medium |
| Rice | Os07g0503300 (OsUGT707A5)- identity=37.9; qcov=1.04; evalue=1.89e-85; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009454 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057792765.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057792765.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792765.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792765.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792765.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:75007912 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C19 |
Chr2:75007955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr2:75007964 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr2:75008093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B28,B94 |
Chr2:75008134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B42,B43,B59,B95,C48 |
Chr2:75008170 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B32,B57,C14,C43,D4 |
Chr2:75008175 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B125,C37,C58 |
Chr2:75008180 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C44,C46 |
Chr2:75008227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,C18 |
Chr2:75008246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B30,B8,C11,C69 |
Chr2:75008327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B76,B98 |
Chr2:75008360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792765.1PF00201
UDPGT 264-403 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792765.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 264 | 403 | 5.2e-24 | 85.6 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。