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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005485`

染色体: Chr02 坐标: 75044541-75045695 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005485`
名称	SmilChr02G005485
描述	VQ motif-containing protein 22
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75044541 - 75045695 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009471`
GeneID	`131009471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009471`
原始查询	`SmilChr02G005485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 22
产物	VQ motif-containing protein 22
Arabidopsis	`AT3G22160` (AT3G22160) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821780] identity=82.3; qcov=0.271; evalue=1.4e-14; confidence=weak
Rice	`Os02g0173200` (OsVQ5) - identity=57.4; qcov=0.362; evalue=7.99e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792798.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792798.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792798.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792798.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75044873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr2:75044875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:75044880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C6
`Chr2:75044902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:75044915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:75044970`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A8,B110,B114,B18,B21,B36,B66,B77,B86,B97,C31,C36,C44,C64,C66,C84,D11,D2,D5
`Chr2:75044973`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A8,B110,B114,B18,B21,B36,B66,B77,B86,B97,C31,C36,C44,C64,C66,C84,D11,D2,D5
`Chr2:75044991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A19,B11,C26,C37
`Chr2:75045003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr2:75045007`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B107,B27,C1,C13
`Chr2:75045007`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B107,B27,C1,C13
`Chr2:75045010`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792798.1

188 aa

188

PF05678 VQ 82-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792798.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	82	107	5.9e-10	39.2	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936815.1
TTATTCAATTATAACGAAATTTAGTGTACTAAAATGATTCGAATACAGTCTATACAGACACTGTATTCATACATCAAGATAATACATTTGTCGTATAACTAAAAAAAAACACAAAAGAAGACTTAAAAAGACCAAGACTAGCTACTAGCTTAGCTCCCCCACTATATAAATACTTCAATCCAATGACTCTAAACACCTTTCATCCTCTCATCTCTCTCTCTCCTTCTTACCATCTTTCATCTTTCTCTCTCCAAAACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009471
ATGGCTATTAGCCAAACCATGTCAAACCCTAGTGATTGGCTATTCCAACAACCCTACCAAAACAACGACTTCTCTCACATCAACCAAACCCTCCAAACTCCTCCCACCACCACCACCCCCACCGCCGCCGCCTTCTCCGCCGCCGCCGCCGCGAGGGCCAACGGCTCAAGCAGCAGCAACTTGAGCCCGGAGCAAGGCCGCGTGGCCAAGCCCGTGCGGCGGCGGTCGAGGGCCTCGCGGCGGACCCCCACCACCCTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792798.1
MAISQTMSNPSDWLFQQPYQNNDFSHINQTLQTPPTTTTPTAAAFSAAAAARANGSSSSNLSPEQGRVAKPVRRRSRASRRTPTTLLNTDTANFRAMVQHFTGGPAAAASSSVSFAARQQQIVPGRGRGAVSYMDQHHAAAAAPGGFHVQYPSQMFVMDSVHGGGGGGAPPHAAAGSGNRINYDQFMV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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