当前解析结果
SmilChr02G005487| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005487 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005487 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005487 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 75058151 - 75062300 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009464 |
|---|---|
| GeneID | 131009464 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009464 |
| 原始查询 | SmilChr02G005487 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009464 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057792785.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057792785.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792787.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792787.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792787.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:75060483 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C14 |
Chr2:75060483 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr2:75060535 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B34,C10,C39,C67 |
Chr2:75061075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr2:75061089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B56,B96,C8,C81 |
Chr2:75061125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B17,C1,D10 |
Chr2:75061127 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B59 |
Chr2:75061127 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B59 |
Chr2:75061232 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B79,C35,C57 |
Chr2:75061258 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B67,B85,C54 |
Chr2:75061300 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 203 | A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B6,B61,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B82,B85,B87,B9,B91,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D9 |
Chr2:75061520 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B128,B129,B135,B15,B42,B5,B64,C10,C12,C24,C81,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。