当前解析结果
SmilChr02G005496| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005496 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005496 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 82A1 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 75121995 - 75125320 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009455 |
|---|---|
| GeneID | 131009455 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009455 |
| 原始查询 | SmilChr02G005496 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 82A1 |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 82A1 |
| Arabidopsis | AT3G22250 (AT3G22250)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821795] identity=53.3; qcov=1.04; evalue=4.72e-163; confidence=high |
| Rice | Os02g0634100 (OsSTA67)- identity=43.8; qcov=0.67; evalue=2.67e-75; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009455 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057792766.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057792766.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792766.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792766.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792766.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:75122238 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B119,C35 |
Chr2:75122288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B2,C2,C68 |
Chr2:75122327 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,D1 |
Chr2:75122358 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,C17 |
Chr2:75122446 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B133,B15,C39 |
Chr2:75122485 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,C42 |
Chr2:75122517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr2:75122518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:75122520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:75122562 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,D1 |
Chr2:75122584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B63,C46 |
Chr2:75122585 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792766.1PF00201
UDPGT 269-410 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792766.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 269 | 410 | 9e-25 | 88.2 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。