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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005498`

染色体: Chr02 坐标: 75132993-75137687 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005498`
名称	SmilChr02G005498
描述	protein PAT1 homolog 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75132993 - 75137687 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009447`
GeneID	`131009447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009447`
原始查询	`SmilChr02G005498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PAT1 homolog 1
产物	protein PAT1 homolog 1
Arabidopsis	`AT3G22270` (AT3G22270) Topoisomerase II-associated protein PAT1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821797] identity=55.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0517300` - identity=53.2; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000290 (deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0000932 (P-body); GO:0003723 (RNA binding); GO:0033962 (P-body assembly)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792758.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792758.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057792758.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057792758.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057792758.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75134279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C46
`Chr2:75134973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:75135110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:75135551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B138,B35,D9
`Chr2:75135586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:75135590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:75135715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A6,B113,B136,D3
`Chr2:75135861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C72
`Chr2:75135989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B2
`Chr2:75136146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C13,C24,C83
`Chr2:75136166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,C13,C24,C83,C86
`Chr2:75136215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936775.1
CCCAACATCAAAAACATAGATCGCAAAAGTCAATGCTAAATTCTTACTTACTACGTCTGCTCATTCAATACACTCTTTAATTTTTTATTAATCAGATTAGATTAGATTAGATTAGAATTAGATAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATCTCTCTCTCTTCTCGCGCTGAAGCGAATATACATACAATTTATATACATATACAATGCTCCACCACCCCCTCCCCCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTACCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009447
ATGGAGAGATCTGGAGGGAAAGATCTCAGCGACTTCACGGACCAATCCAGCAGCTCATTATCTGATGCGGCGCTGTTTGATGCGTCGCAATATACTTTTTTTGGGAAAGGTGCGGTGGATGAAGTGGAATTGGGGGGATTTGAAGATGAAGATGAGTCTGCTCCTGGAGTGGAAGGCAGAATTGGTGGGGAAGATGATCTGAATGAGTATCATTTGTTTGACAAAGATGAGGGATCAGGATTAGGACCATTATCTGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792758.1
MERSGGKDLSDFTDQSSSSLSDAALFDASQYTFFGKGAVDEVELGGFEDEDESAPGVEGRIGGEDDLNEYHLFDKDEGSGLGPLSDIDDLATTFAKLNKVVSGPRHPGVIGDRGSGSFSRESSSATEWAREADFPDWGDHHMSDSECYEENKRWSSQPHLSSLFRRESTPLYRTSSYPEQQQPLQHCSSEPILVPKSSFTSFPPPGSQQASPNSGHHLSLSSLSGGPQLPFSSSSNSSLANSALLLSGLQRGYHYNPNMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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