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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005518`

染色体: Chr02 坐标: 75289006-75290981 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005518`
名称	SmilChr02G005518
描述	receptor-like protein EIX2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75289006 - 75290981 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009480`
GeneID	`131009480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009480`
原始查询	`SmilChr02G005518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein EIX2
产物	receptor-like protein EIX2
Arabidopsis	`AT2G34930` (AT2G34930) disease resistance family protein / LRR family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818058] identity=38.5; qcov=0.817; evalue=6.6e-60; confidence=medium
Rice	`Os11g0564900` - identity=36.4; qcov=0.959; evalue=1.15e-68; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792808.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792808.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792808.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792808.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75289448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B113,B24,B27,B8,B83,B86,C13,C36,C4,C76
`Chr2:75289482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B50,C14,C42,C70
`Chr2:75289502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C45,C58,C87
`Chr2:75289518`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A16,B113,B13,B138,B70,B80,B90,B98,C62,C74,C78
`Chr2:75289521`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A16,B113,B13,B138,B70,B80,B90,B98,C62,C74,C78
`Chr2:75289648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B83,B86,C13,C76
`Chr2:75289656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,B86,C13,C76
`Chr2:75289679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C87
`Chr2:75289731`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B23,B70,C69
`Chr2:75289731`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B23,B70,C69
`Chr2:75289808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B140,C67,C74,D10
`Chr2:75289850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A25,B67,B72,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792808.1

410 aa

205

410

LRR_1

PF00560 LRR_1 19-37 aa PF00560 LRR_1 41-61 aa PF00560 LRR_1 114-135 aa PF00560 LRR_1 138-159 aa PF00560 LRR_1 215-236 aa PF00560 LRR_1 239-259 aa PF00560 LRR_1 263-284 aa PF00560 LRR_1 287-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	19	37	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	41	61	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	114	135	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	138	159	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	215	236	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	239	259	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	263	284	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057792808.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	287	304	5.1e-31	100.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936825.1
TTTCAGTTGGATGGTATACATTTAGCAGGATGCAATGTGGGCCCATCTTTCCCAAAATGGATCCAAACTCAGAGGATTTTGTTAACCCTTGATCTCTCTAGAGCCGGCATAAGAGATGAAGCCCCAACGTGGTTGTGGACTATATCCCCTTCATTAAAGGCCTTATATCTTTCTGACAATCAAATTACTGGTTCTGTTCCTAATCTCTCATCCACTTCCATCACATACTTAGATCTTAGTAACAATAATTTCTCAGGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009480
ATGTTTTCTGGTTCAATTTCATCTATTTGCAAAATTCCCCAATATCAAATTTGGATCATGGATCTCTCCAATAATAAGTTGGCAGGAGAGATTCCCAACTGTTGGGATAAAATGCCATACTTATTCTCTCTCAATTTGGCCGACAACAGTTTTTCGGGTGAAATTCCTCGCTCTTTGGGCTCTAATTTGCTTGATTTCAGTGCACTGCAGTTGCGTGGTAATAATTTATCTGGAGAGTTGCCTTCCACTTTGAGACTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792808.1
MFSGSISSICKIPQYQIWIMDLSNNKLAGEIPNCWDKMPYLFSLNLADNSFSGEIPRSLGSNLLDFSALQLRGNNLSGELPSTLRLCQRLNMIDVEGNALTGEIPTWIGELYHMRFLNIHGNKLHGSIPPHICNLTDIRILDLSMNYLSGKIPDCFNNFTTLAQKNTILDNWLGYYLWVHYNGNLPNEKIRPVYEYSAIQWKGQESEYRKNLRLLKLIDFSSNSLTGNIPKSFSSMLGLISLNLSRNSLTGNIIGDIGEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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