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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005535`

染色体: Chr02 坐标: 75395535-75398777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005535`
名称	SmilChr02G005535
描述	reticulon-like protein B8
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75395535 - 75398777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009496`
GeneID	`131009496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009496`
原始查询	`SmilChr02G005535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B8
产物	reticulon-like protein B8
Arabidopsis	`AT3G10260` (AT3G10260) Reticulon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820188] identity=60.5; qcov=0.996; evalue=4.81e-110; confidence=high
Rice	`Os03g0781700` - identity=58.9; qcov=0.976; evalue=2.25e-100; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057792841.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057792841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792841.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792841.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75395788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:75395825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B50,C14,C42
`Chr2:75395825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75395841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr2:75395852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B11,B112,C37,C47
`Chr2:75395853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B129,B24
`Chr2:75395868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75395892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:75396061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B110,B113,B41,C42
`Chr2:75396062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:75396080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:75396097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792841.1

249 aa

124

249

Reticulon

PF02453 Reticulon 63-217 aa

XP_057792842.1

249 aa

124

249

Reticulon

PF02453 Reticulon 63-217 aa

XP_057792843.1

249 aa

124

249

Reticulon

PF02453 Reticulon 63-217 aa

XP_057792844.1

249 aa

124

249

Reticulon

PF02453 Reticulon 63-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792841.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	63	217	5.3e-55	186.3	Reticulon
`XP_057792842.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	63	217	5.3e-55	186.3	Reticulon
`XP_057792843.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	63	217	5.3e-55	186.3	Reticulon
`XP_057792844.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	63	217	5.3e-55	186.3	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936859.1
TTACCAAAGCATTAAATTCTTAGCCTTTTGGGACACTTTCATTACCTACTCAAATTACTTCAAGTAATATATGATAATTAAATCTGATTATAAGTTAAGTAGGAACATAAATATGCTATAATTAACACAGCAGCTGGGTAGGTGGAGCCAAGCGGTGGCTGCCACTGTAATTGATGTGTATCCAATTCATGTATCATGTATGCATTGAAATGGGCTGCATGAATTGAATTCAGAGAGGCTCGAATTCGTGGGACTCTAAA...

XM_057936858.1
ACCAAAGCATTAAATTCTTAGCCTTTTGGGACACTTTCATTACCTACTCAAATTACTTCAAGTAATATATGATAATTAAATCTGATTATAAGTTAAGTAGGAACATAAATATGCTATAATTAACACAGCAGCTGGGTAGGTGGAGCCAAGCGGTGGCTGCCACTGTAATTGATGTGTATCCAATTCATGTATCATGTATGCATTGAAATGGGCTGCATGAATTGAATTCAGAGAGGCTCGAATTCGTGGGACTCTAAAGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131009496
ATGCCCGAGGGAATAACAGCTGAGGCTCTGATGAGCAATATCAGAGAAACGTTCTCAGATAGCGTATCAAAGAACAAAAACGTGTCGTTCTTTGAAGAGGAGAAGTCGAGTTCTGTAACTTATCAGTTCAACAAATTGTTTGGACGCGATAAACCCATTCACCATCTTTTAGGGGGCGGCAAATCTGCTGATGTGCTCTTATGGAGGAACAAGAAGATCTCGGCTAGTGTGCTGACTTCTGCTACGGTTGTTTGGGTGCT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057792841.1
MPEGITAEALMSNIRETFSDSVSKNKNVSFFEEEKSSSVTYQFNKLFGRDKPIHHLLGGGKSADVLLWRNKKISASVLTSATVVWVLFEWLNYNFLTLVSFALMLGMLAQFVLKNASGILNRSPSKVPRLVLPEEVFINIGKAVGSEVNHGLRFLQDVACGGDIKQFLVAVASLWAAAIIGSWFNFLTVLYIGFVAAHTLPILYERYDDQVDAFVYNLLGQLEQNYRKLNAGVLSRIPKGKAARTKKAE

XP_057792842.1
MPEGITAEALMSNIRETFSDSVSKNKNVSFFEEEKSSSVTYQFNKLFGRDKPIHHLLGGGKSADVLLWRNKKISASVLTSATVVWVLFEWLNYNFLTLVSFALMLGMLAQFVLKNASGILNRSPSKVPRLVLPEEVFINIGKAVGSEVNHGLRFLQDVACGGDIKQFLVAVASLWAAAIIGSWFNFLTVLYIGFVAAHTLPILYERYDDQVDAFVYNLLGQLEQNYRKLNAGVLSRIPKGKAARTKKAE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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