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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005536`

染色体: Chr02 坐标: 75400665-75404228 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005536`
名称	SmilChr02G005536
描述	oxygen-evolving enhancer protein 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75400665 - 75404228 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009499`
GeneID	`131009499`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009499`
原始查询	`SmilChr02G005536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxygen-evolving enhancer protein 2, chloroplastic-like
产物	oxygen-evolving enhancer protein 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G06680` (PSBP-1) photosystem II subunit P-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837178] identity=70.3; qcov=1; evalue=5.04e-135; confidence=high
Rice	`Os07g0141400` (PsbP) - identity=66.3; qcov=0.996; evalue=1.84e-113; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009499

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792849.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057792849.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057792849.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792849.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75400957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75401000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,C57,C65,C87
`Chr2:75401066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75401078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B129,B31,C55
`Chr2:75401091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75401116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75402225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:75402333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75402348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C55
`Chr2:75402369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75402374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C42
`Chr2:75402391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792849.1

265 aa

132

265

PsbP

PF01789 PsbP 96-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792849.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	96	264	7.3e-36	124.3	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936866.1
TCGAGATCACTATAACGTGATTTTTAAATTTTTTATTAATGAAAAATTAAGAAGAAGAACAAAAAAAAGAAGCATCTACACAACCTTATCCTCTAATCCCACATACAATCCTATAGACTTTTCTCATTTGCCAATTGCCACCTCACCACAACACTCCAAGACTTTTCTCAACATAAAAAAACACACACAACACACACTGCCACCACTCTTGATCAACCTCTCACATCAAGAAACTTCAAGAAAAAAAAAATGGCTTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009499
ATGGCTTCATCAACTGCTTGCTTCTTGCATTGCTCTAGCTTTGCTGCTGCAGCAAGAACTTCTTCCCGAAGCTACGCGCCGCCGCCGAAGCCTAAACGGCTGATCTGCCGGGCCCAGAAGCAGGCGGAGGCGGAGGCGGCGCAAGAAAATGCCGCCGCCGCCGTGTCACGGAGATTAGCCCTCACTTTCTTGATTGGTGCTGCTGCTCTTGGCTCCAAAGTCTCACCTGCTGAGGCTGCTTATGGACAAACTGCCAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792849.1
MASSTACFLHCSSFAAAARTSSRSYAPPPKPKRLICRAQKQAEAEAAQENAAAAVSRRLALTFLIGAAALGSKVSPAEAAYGQTANIFGKPKTNTDFRPYNGDGFKVKLPAKWNPSGEVEYPGQVLRYEDNFDPDSNLVVTVTPTDKKSITDYGAPEKFISQVDYLLGKQAYFGQTDSEGGFDSGAVATANILETATPTIDGKQYYFVSVLTRTADGDEGGKHHLISATVKDGKLYICKAQAGDKRWFKGTRKFVESAAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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