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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005545`

染色体: Chr02 坐标: 75446144-75452739 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005545`
名称	SmilChr02G005545
描述	protein argonaute MEL1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75446144 - 75452739 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009506`
GeneID	`131009506`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009506`
原始查询	`SmilChr02G005545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein argonaute MEL1-like
产物	protein argonaute MEL1-like
Arabidopsis	`AT2G27880` (AGO5) Argonaute family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817334] identity=53; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0800200` (MEL1) - identity=55.3; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0035194 (regulatory ncRNA-mediated post-transcriptional gene silencing)
KEGG	-
Pfam	PF02170 (PAZ); PF02171 (Piwi); PF08699 (ArgoL1); PF16486 (ArgoN); PF16487 (ArgoMid); PF16488 (ArgoL2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009506

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792868.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792868.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057792868.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057792868.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057792868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75446319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B46,B5,B66,B76
`Chr2:75446385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C48
`Chr2:75446411`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	160	A1,A14,A16,A19,A2,A20,A22,A23,A3,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B107,B108,B11,B112,B113,B114,B115,B117,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B132,B133,B134,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B41,B45,B46,B48,B49,B5,B54,B55,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B7,B70,B71,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C86,C87,D1,D2,D3,D5,D6,D7
`Chr2:75446457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75446733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:75446866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr2:75446867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75446875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:75447008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:75447245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B46,C82
`Chr2:75447355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:75447491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792868.1

919 aa

460

919

ArgoN

ArgoL1

PAZ

ArgoL2

ArgoMid

Piwi

PF16486 ArgoN 79-206 aa PF08699 ArgoL1 217-266 aa PF02170 PAZ 276-396 aa PF16488 ArgoL2 407-452 aa PF16487 ArgoMid 463-539 aa PF02171 Piwi 559-880 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF16486`	ArgoN	Domain	79	206	3.2e-28	99.6	N-terminal domain of argonaute
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF08699`	ArgoL1	Domain	217	266	1.2e-15	57.6	Argonaute linker 1 domain
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF02170`	PAZ	Domain	276	396	1.1e-28	100.3	PAZ domain
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF16488`	ArgoL2	Family	407	452	1.5e-10	41.9	Argonaute linker 2 domain
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF16487`	ArgoMid	Domain	463	539	3.1e-09	37.7	Mid domain of argonaute
`XP_057792868.1`	Pfam	`PF02171`	Piwi	Domain	559	880	1.1e-104	350.7	Piwi domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936885.1
ACACACACACAGCACACTCTCTCTCTCGTTCCGTACACAGCAAACACACACACACACGCACACACCATGTGGATTCCTGCGAAGCCCAAGAATATCGGCAGGATCTGCTGCCAGCCCGACTGGGCACCTCACCAGCCGGCTGAGCCGGCGGTGTGGCTATCATTGTCGATGGAGCAGAAGCTTGACCTCGAGGCATCTGCTTCAACACCGGAGCAGGCGGCACAGCCGGAGAACCCTCCTCCGGTTCAACCAGAATTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009506
ATGTGGATTCCTGCGAAGCCCAAGAATATCGGCAGGATCTGCTGCCAGCCCGACTGGGCACCTCACCAGCCGGCTGAGCCGGCGGTGTGGCTATCATTGTCGATGGAGCAGAAGCTTGACCTCGAGGCATCTGCTTCAACACCGGAGCAGGCGGCACAGCCGGAGAACCCTCCTCCGGTTCAACCAGAATTGCCTCTGGCACGGAGGCCTGGATTTGGACATGCCGGCCTTGAAATTATAATAAAGGCCAACCATTTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792868.1
MWIPAKPKNIGRICCQPDWAPHQPAEPAVWLSLSMEQKLDLEASASTPEQAAQPENPPPVQPELPLARRPGFGHAGLEIIIKANHFLVAVADKDLHHYDVSISPEVASKKVCREIIDLVMKGCDFPKEKLAYDGRSSCYAASSLPFESKYFAVELVDADSQSRRIRKFQVSIKLSSKPDLYQLKQFIQGRQLDLPQETIQLFNVVLKQYQYKSGLVVGRSCFHRGMGNGRDLGNGLDYVPGFYQSLRPTQMGLSLNIDMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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