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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005563`

染色体: Chr02 坐标: 75556142-75559613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005563`
名称	SmilChr02G005563
描述	uncharacterized SmilChr02G005563
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75556142 - 75559613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009529`
GeneID	`131009529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009529`
原始查询	`SmilChr02G005563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0155000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0155000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G63780` (IMP4) Ribosomal RNA processing Brix domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842682] identity=75.3; qcov=1; evalue=3.62e-166; confidence=high
Rice	`Os08g0155000` - identity=75.5; qcov=0.997; evalue=2.58e-168; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034457 (Mpp10 complex); GO:0042134 (rRNA primary transcript binding)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04427 (Brix)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792910.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057792910.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792910.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792910.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75556718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr2:75557135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B125,B126,B85
`Chr2:75557161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:75557167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C42
`Chr2:75557181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:75557576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:75557686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B30,B48
`Chr2:75557688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75559393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C62
`Chr2:75559404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792910.1

295 aa

148

295

Brix

PF04427 Brix 90-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792910.1`	Pfam	`PF04427`	Brix	Domain	90	262	1.9e-26	94.0	Brix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936927.1
AGCACATATTTTTTGTTTCGAAAGATCCACCGGTGAAGATCTACCGTACGTTACAAAAGATGAAGAACTATCGTGCTGTGAGGTCCGTGAAGAACTACCGTAGGTTACAAAAGATGAAGAACTAACATGCCGTGAACGTGAAGAATTACCGCCCATTAGAGAGAGAAGGGGATGGAGGAGGGAGGAGAGCTGTAAGGAGAGATAGCTGCTGATTATTTTGAAAACTTGTATACTTTTATTTAGGTTTTTATTTTTATTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009529
ATGTTGAAGAGAAACGTGAGATTGAGGAGAGAGTATCTCTACCGGAAGAGCTTGGAAGGGAAAGAGCGCTTGCTCTACGAGAAGAAGCGCAAAATTCGCGAAGCCTTGGAAGAGGGAAAGCCGATTCCTACTGAGCTCAGGAACGAGGAGGCCGCCCTCCGCCAGGAAATCGACCTTGAAGACGAACAAACCGCTGTTCCCCGATCGAGCATTGATGATGAATATGCAAATGCAACTGTCAGTGATCCTAAGATTTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792910.1
MLKRNVRLRREYLYRKSLEGKERLLYEKKRKIREALEEGKPIPTELRNEEAALRQEIDLEDEQTAVPRSSIDDEYANATVSDPKILLITSRDPSAPLAQFVKELKFVFPNAQRMNRGGQVISEIIETCRSHDFTDVISVHENRGVPDGLVISHLPFGPTAYFRLHNVVTRHDIKDKKAIGTMPEAYPHLIINNFNSKLGQRTANILKHLFPVPKPDTKRIITFAREPQSDWISFRHHLYEKRGGPKSVDLKEIGPRFEMF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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