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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005564`

染色体: Chr02 坐标: 75564504-75571215 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005564`
名称	SmilChr02G005564
描述	GBF-interacting protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75564504 - 75571215 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009521`
GeneID	`131009521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009521`
原始查询	`SmilChr02G005564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GBF-interacting protein 1-like
产物	GBF-interacting protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G13222` (GIP1) GBF-interacting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820513] identity=41.8; qcov=0.229; evalue=2.93e-29; confidence=weak
Rice	`Os06g0206100` - identity=29.7; qcov=0.514; evalue=1.85e-26; confidence=low
GO	GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	-
Pfam	PF06972 (GIP1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792898.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057792898.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057792898.1`
4	P-body	P-body	0.80000	`XP_057792899.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057792898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75565273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B27,C11,C69,C87
`Chr2:75565379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75565585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B51,B66
`Chr2:75565772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75565844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:75565964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B139
`Chr2:75566500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B98,C22,C45,C58
`Chr2:75566501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C44
`Chr2:75566536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75566999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:75567011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr2:75567076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792898.1

879 aa

440

879

GIP1_N

PF06972 GIP1_N 14-74 aa

XP_057792899.1

877 aa

438

877

GIP1_N

PF06972 GIP1_N 14-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792898.1`	Pfam	`PF06972`	GIP1_N	Domain	14	74	8.4e-32	109.9	GBF-interacting protein 1 N-terminal
`XP_057792899.1`	Pfam	`PF06972`	GIP1_N	Domain	14	74	8.4e-32	109.9	GBF-interacting protein 1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936916.1
TATAATTTCAATTAATTTCACAATCATCATTCTACAAAAACCCTTTCCCCCAAGTCTTCCCCTCTCCTCTTTCCCTAAAATACAAAAATCATACACACACACACACACACACACTGCCCCCCTCTCCCTCTCTCTCCCCCCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTAGAACGGAAGGAGGTCCATCTATATAGAGCTTCATTGCATTCACAATTCATACATACTATTGTCCATCTGCGCAGAATTTTGCACACAAGTGTGTGTTTT...

XM_057936915.1
TATAATTTCAATTAATTTCACAATCATCATTCTACAAAAACCCTTTCCCCCAAGTCTTCCCCTCTCCTCTTTCCCTAAAATACAAAAATCATACACACACACACACACACACACTGCCCCCCTCTCCCTCTCTCTCCCCCCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTAGAACGGAAGGAGGTCCATCTATATAGAGCTTCATTGCATTCACAATTCATACATACTATTGTCCATCTGCGCAGAATTTTGCACACAAGTGTGTGTTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009521
ATGAGCAGTGGGGTTAAGGGAGGTGCAAGTAGGGTTTCGATTCCGAGCGGCGTTAAGAAGACGATCGAGAATATAAAGGAGATTACTGGCCAGAATCACTCCGAAGATGAGATTTATGCAATGCTCAAGGAATGTTCGATGGATCCCAACGAAACTACTCAGAAGCTTCTACTTCTCGATACCTTTCATGAAGTAAAAAGAAAACGTGACAGGAGAAAGGAGAATCAAAATAAGGAGCCTGCCGAGAAGTGGAAACCTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792898.1
MSSGVKGGASRVSIPSGVKKTIENIKEITGQNHSEDEIYAMLKECSMDPNETTQKLLLLDTFHEVKRKRDRRKENQNKEPAEKWKPGTQARPNRVGRGNYPSRYASHDAGGGRNSPAIKESSASHLTEKSTSKAPLAAPQDVRKSETSSGTSLITGVSNGPSGIAPQSANPTAIHNKSEKPLLVSSAIDSVKNLNTPPVKDTQQHPILESSENATSIPSALGSYFSSSDAVLLHSQDSPPPSAVGSIHHEVGSQRAPGQM...

XP_057792899.1
MSSGVKGGASRVSIPSGVKKTIENIKEITGQNHSEDEIYAMLKECSMDPNETTQKLLLLDTFHEVKRKRDRRKENQNKEPAEKWKPGTQARPNRVGRGNYPSRYASHDAGGGRNSPAIKESSASHLTEKSTSKAPLAAPQDVRKSETSSGTSLITGVSNGPSGIAPQSANPTAIHNKSEKPLLVSSAIDSVKNLNTPPVKDTQQHPILESSENATSIPSALGSYFSSSDAVLLHSQDSPPPSAVGSIHHEVGSQRAPGQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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