当前解析结果
SmilChr02G005574| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005574 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005574 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005574 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 75608762 - 75610806 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009538 |
|---|---|
| GeneID | 131009538 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009538 |
| 原始查询 | SmilChr02G005574 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009538 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057792919.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057792919.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057792919.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792919.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792919.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:75608905 |
A |
ATT |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 3 | B50,C14,C42 |
Chr2:75608905 |
A |
ATT |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B50,C14,C42 |
Chr2:75608971 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:75609018 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B23,B79,C25,D11 |
Chr2:75609029 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 79 | A11,A16,A21,A22,A9,B1,B100,B102,B105,B11,B110,B111,B120,B121,B123,B125,B128,B129,B13,B131,B133,B136,B139,B16,B2,B21,B23,B26,B32,B34,B35,B37,B4,B40,B42,B46,B48,B50,B64,B67,B68,B7,B70,B73,B74,B75,B76,B77,B82,B88,B91,B95,B97,B99,C21,C22,C24,C34,C35,C39,C40,C44,C47,C5,C55,C57,C6,C60,C64,C67,C69,C7,C74,C81,C83,C84,C87,D3,D9 |
Chr2:75609049 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 55 | A11,A16,A9,B100,B11,B120,B123,B128,B130,B131,B133,B136,B2,B21,B23,B26,B29,B32,B35,B4,B46,B48,B50,B53,B60,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B77,B82,B88,B95,B99,C21,C22,C24,C34,C35,C40,C44,C47,C5,C57,C60,C61,C64,C67,C7,C83,D3,D9 |
Chr2:75609082 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 40 | A23,A24,A25,A7,A8,B105,B108,B111,B113,B117,B129,B13,B130,B136,B137,B34,B37,B42,B43,B58,B59,B60,B63,B95,C11,C23,C26,C28,C29,C36,C4,C40,C58,C6,C64,C66,C69,C73,C75,C77 |
Chr2:75609086 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 40 | A23,A24,A25,A7,A8,B105,B108,B111,B113,B117,B129,B13,B130,B136,B137,B34,B37,B42,B43,B58,B59,B60,B63,B95,C11,C23,C26,C28,C29,C36,C4,C40,C58,C6,C64,C66,C69,C73,C75,C77 |
Chr2:75609088 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 47 | A10,A13,A20,A22,A8,B103,B104,B117,B118,B12,B122,B123,B124,B137,B14,B19,B3,B31,B33,B44,B51,B52,B55,B57,B6,B61,B70,B78,B79,B81,B87,B90,B92,C12,C16,C23,C29,C33,C37,C38,C41,C48,C53,C56,C62,C82,D10 |
Chr2:75609108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B43 |
Chr2:75609155 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C34 |
Chr2:75609158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。