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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005579`

染色体: Chr02 坐标: 75628944-75631832 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005579`
名称	SmilChr02G005579
描述	(S)-ureidoglycine aminohydrolase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75628944 - 75631832 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009545`
GeneID	`131009545`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009545`
原始查询	`SmilChr02G005579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(S)-ureidoglycine aminohydrolase
产物	(S)-ureidoglycine aminohydrolase
Arabidopsis	`AT4G17050` (UGLYAH) ureidoglycine aminohydrolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827413] identity=75.8; qcov=0.97; evalue=8.51e-170; confidence=high
Rice	`Os07g0495000` (OsUGlyAH) - identity=74.4; qcov=0.93; evalue=1.7e-155; confidence=high
GO	GO:0071522 (ureidoglycine aminohydrolase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009545

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057792934.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057792934.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792934.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792934.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75629071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75629074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B18,B97,C73
`Chr2:75629101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B60
`Chr2:75629119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:75629121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:75629225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B70
`Chr2:75629240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C60,C67
`Chr2:75629426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr2:75629739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:75629895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C55
`Chr2:75630226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:75630242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792934.1

303 aa

152

303

Cupin_2

PF07883 Cupin_2 226-292 aa

XP_057792935.1

302 aa

151

302

Cupin_2

PF07883 Cupin_2 225-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792934.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	226	292	5.7e-13	49.1	Cupin domain
`XP_057792935.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	225	291	5.7e-13	49.1	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936951.1
GCATATAAAAAAAATCCCACAACAGAGAGAATAAGACAGTGAATGAGTGTGAGAGGAATTCTGATTCAACAAACACTGCAAAGATGCAATCTTTCTCTGCATTTTCTGCGCAATTTCTCTTCCTTGCTCTTATCTTTCAGACAGGTTTTGTGAGAATCTCATTCTGCCAAGAAGGGTTTTGCTCTGCGCCGTCAATCTTGGAGGAGCAGCCACTCTACTGGAAGGCCACCAACCCAACTCTCTCACCTTCACATCTTAAA...

XM_057936952.1
AAAAAATCCCACAACAGAGAGAATAAGACAGTGAATGAGTGTGAGAGGAATTCTGATTCAACAAACACTGCAAAGATGCAATCTTTCTCTGCATTTTCTGCGCAATTTCTCTTCCTTGCTCTTATCTTTCAGAGTTTTGTGAGAATCTCATTCTGCCAAGAAGGGTTTTGCTCTGCGCCGTCAATCTTGGAGGAGCAGCCACTCTACTGGAAGGCCACCAACCCAACTCTCTCACCTTCACATCTTAAAGACTTGCCGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009545
ATGCAATCTTTCTCTGCATTTTCTGCGCAATTTCTCTTCCTTGCTCTTATCTTTCAGAGTTTTGTGAGAATCTCATTCTGCCAAGAAGGGTTTTGCTCTGCGCCGTCAATCTTGGAGGAGCAGCCACTCTACTGGAAGGCCACCAACCCAACTCTCTCACCTTCACATCTTAAAGACTTGCCGGGGTTCACGCGCAGTGTGTACAAGAGCGACCATGCTTTGATCACTCCTGAAAGTCATGTCTTCGGCCCTTTGCCCGA...

LOC131009545
ATGCAATCTTTCTCTGCATTTTCTGCGCAATTTCTCTTCCTTGCTCTTATCTTTCAGACAGGTTTTGTGAGAATCTCATTCTGCCAAGAAGGGTTTTGCTCTGCGCCGTCAATCTTGGAGGAGCAGCCACTCTACTGGAAGGCCACCAACCCAACTCTCTCACCTTCACATCTTAAAGACTTGCCGGGGTTCACGCGCAGTGTGTACAAGAGCGACCATGCTTTGATCACTCCTGAAAGTCATGTCTTCGGCCCTTTGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792934.1
MQSFSAFSAQFLFLALIFQTGFVRISFCQEGFCSAPSILEEQPLYWKATNPTLSPSHLKDLPGFTRSVYKSDHALITPESHVFGPLPEWSDTLGAYLITPSMGSHFVMYLAKMQENSKSGLPPKDVERFVFVLHGVVTLIDASSAKHKLEVDSYAYLPPNSRHSLDSSASATLVVLERRYDYLEKHATEQIIGSTSEQPLLETPGEVFELRKLLPTSLPYDFNIHIMDFQPGEFLNVKEVHYNQHGLLLLEGQGIYRLGD...

XP_057792935.1
MQSFSAFSAQFLFLALIFQSFVRISFCQEGFCSAPSILEEQPLYWKATNPTLSPSHLKDLPGFTRSVYKSDHALITPESHVFGPLPEWSDTLGAYLITPSMGSHFVMYLAKMQENSKSGLPPKDVERFVFVLHGVVTLIDASSAKHKLEVDSYAYLPPNSRHSLDSSASATLVVLERRYDYLEKHATEQIIGSTSEQPLLETPGEVFELRKLLPTSLPYDFNIHIMDFQPGEFLNVKEVHYNQHGLLLLEGQGIYRLGDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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