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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005584`

染色体: Chr02 坐标: 75651935-75659614 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005584`
名称	SmilChr02G005584
描述	nuclear pore complex protein NUP133
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75651935 - 75659614 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009549`
GeneID	`131009549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009549`
原始查询	`SmilChr02G005584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP133
产物	nuclear pore complex protein NUP133
Arabidopsis	`AT2G05120` (AT2G05120) Nucleoporin, Nup133/Nup155-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815060] identity=51.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0225500` (NUP133) - identity=50.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000972 (transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery); GO:0005515 (protein binding); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0016973 (poly(A)+ mRNA export from nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0031080 (nuclear pore outer ring)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03177 (Nucleoporin_C); PF08801 (Nucleoporin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792938.1`
2	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057792938.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057792938.1`
4	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.80000	`XP_057792938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75652375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C42,C46,C6,D10
`Chr2:75652411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:75652451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C6,D10
`Chr2:75652464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B94,C61
`Chr2:75652466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:75652640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75652678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:75652766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:75652809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B70,C62
`Chr2:75653281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B66,D5
`Chr2:75654171`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A18,A20,A8,B1,B101,B106,B108,B111,B113,B121,B125,B131,B133,B137,B138,B139,B15,B24,B25,B35,B4,B41,B44,B48,B50,B51,B52,B56,B77,B81,B96,B99,C10,C14,C16,C20,C23,C24,C34,C36,C49,C53,C82,D9
`Chr2:75654172`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,A25,A9,B126,B45,B85,C28,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792938.1

1291 aa

646

1291

Nucleoporin_N

Nucleoporin_C

PF08801 Nucleoporin_N 84-505 aa PF03177 Nucleoporin_C 978-1129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792938.1`	Pfam	`PF08801`	Nucleoporin_N	Repeat	84	505	2e-28	100.1	Nup133 N terminal like
`XP_057792938.1`	Pfam	`PF03177`	Nucleoporin_C	Repeat	978	1129	2.6e-07	30.5	Non-repetitive/WGA-negative nucleoporin C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936955.1
AAGTGCGCTCTTCTCCTTCATAATATGAACCAAAAACCCTAAACCCCAATTAATTCTCAATCTCCCAACTCTTGAGATCCTACCACGAGCAATGTTCTCTCCTCCCGCGAAGAAATCCGGCTTAAGTGCTCGTAAAAATGCATTCGATCGGAGAGACGAAGTATCCACGCCGCTCGCCGAGAACCGGAGGCCGTTGCTCGACAGCCCCGCCGTCCCCAATCGCCCCGCCACCGGCACCCCTGCCCCTTGGGCCTCTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009549
ATGTTCTCTCCTCCCGCGAAGAAATCCGGCTTAAGTGCTCGTAAAAATGCATTCGATCGGAGAGACGAAGTATCCACGCCGCTCGCCGAGAACCGGAGGCCGTTGCTCGACAGCCCCGCCGTCCCCAATCGCCCCGCCACCGGCACCCCTGCCCCTTGGGCCTCTCGCCTTTCCGTTCTCGCCAGAATCCCGCCTGTGAGAAAAAGTGACAGTGGTGATGAGGCACACAGGCCTGTCTATATTGGGGAGTTCCCTCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792938.1
MFSPPAKKSGLSARKNAFDRRDEVSTPLAENRRPLLDSPAVPNRPATGTPAPWASRLSVLARIPPVRKSDSGDEAHRPVYIGEFPQEVRDAQIISSQNRVPADTSISGGMDKATSFAWIICGNKLFIWNHLLTAASRKCIILDLTSVTSENGEMGKGYSQNNNWLVCLINWDGSKKTGSKVTQQSSSAGIVMCNKKTRTLVFWPDIYNANRVPPLTCVIRQNYSINSLIASAIPSATNSCIALACSSDGVLCRFLCTPTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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