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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005596`

染色体: Chr02 坐标: 75704910-75706462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005596`
名称	SmilChr02G005596
描述	thymidine kinase a
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75704910 - 75706462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009560`
GeneID	`131009560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009560`
原始查询	`SmilChr02G005596`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thymidine kinase a
产物	thymidine kinase a
Arabidopsis	`AT3G07800` (TK1a) Thymidine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819971] identity=67.3; qcov=0.846; evalue=9.06e-103; confidence=high
Rice	`Os03g0113100` (TK) - identity=77; qcov=0.744; evalue=2.89e-103; confidence=high
GO	GO:0004797 (thymidine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0046104 (thymidine metabolic process)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00265 (TK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792948.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792948.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792948.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792948.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75705103`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A13,A22,A4,A5,B100,B106,B115,B117,B120,B14,B20,B25,B31,B32,B33,B48,B49,B5,B50,B57,B62,B73,B90,B92,C1,C12,C17,C24,C30,C38,C44,C56,C61,C78,C8,D2,D6
`Chr2:75705116`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A13,A22,A4,A5,B100,B106,B115,B117,B120,B14,B20,B25,B31,B32,B33,B48,B49,B5,B50,B57,B62,B73,B90,B92,C1,C12,C17,C24,C30,C38,C44,C56,C61,C78,C8,D2,D6
`Chr2:75705156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:75705236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C59,C78
`Chr2:75705336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,A8
`Chr2:75705977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792948.1

246 aa

123

246

PF00265 TK 41-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792948.1`	Pfam	`PF00265`	TK	Family	41	218	3.1e-51	174.4	Thymidine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936965.1
GGGGGATTTATGGCGGTTCGGAACAGTACGCTGCACGCTTCAATCTCGATTCAAATTTCCCTCTCAAATTTTCAATTTTCGATTCAAATTACTACCTTTTTTGGTTACAAAAAAATTCAACCTTGATCGTCTACTATAAAATGCGAGTCGAAAATGCAGAATAATCCACCATCGACAACCACCACCAACCATTCTTCCACTTTTCTACTTCACTCCCCAATCCCAATTCCAATCCCAATCATGCCTCATCTCCCCGGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009560
ATGCAGAATAATCCACCATCGACAACCACCACCAACCATTCTTCCACTTTTCTACTTCACTCCCCAATCCCAATTCCAATCCCAATCATGCCTCATCTCCCCGGCCCCTATCGCCGCCCCGGCGAAGTGCACGTCATCGTCGGACCCATGTTCGCCGGCAAATCCACCGCCCTCCTCCGCCGCGTCACCGCCGAATCTGATTCCGGCAGGGCTGTGGCGATGATCAAGTCGAGTAAGGATACTCGATACGCGGTGGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792948.1
MQNNPPSTTTTNHSSTFLLHSPIPIPIPIMPHLPGPYRRPGEVHVIVGPMFAGKSTALLRRVTAESDSGRAVAMIKSSKDTRYAVDAVVTHDGTKFPCWPLPDLLSFKREIGAEAYQKLDVIGIDEAQFFGDLYDFCCEAADLDGKTVVVAGLDGDYLRRSFGSVLDIIPLADTVTKLTARCELCGKRAFFTLRKTGELQTELIGGADVYMPVCRLHYGNEQRGVSMEAAVVKDKEDLIVETTAAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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