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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005601`

染色体: Chr02 坐标: 75717850-75719455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005601`
名称	SmilChr02G005601
描述	polygalacturonase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75717850 - 75719455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009565`
GeneID	`131009565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009565`
原始查询	`SmilChr02G005601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase-like
产物	polygalacturonase-like
Arabidopsis	`AT3G07840` (AT3G07840) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819975] identity=46.5; qcov=0.988; evalue=7.2e-131; confidence=high
Rice	`Os06g0611400` (OsPGL5) - identity=39; qcov=1.03; evalue=2.47e-94; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057792961.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057792961.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792961.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792961.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75718400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:75718526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B45,B70,B87,C21
`Chr2:75718769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr2:75719092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:75719174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B123,C23,C5,D9
`Chr2:75719340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B23,B8,C50,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792961.1

405 aa

202

405

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 49-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792961.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	49	382	1.2e-91	307.9	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936978.1
AACTGACATGCATCACCTCAATTAAACACACATCGATCAACATGGAACAAAAGCATCTCATCTCCGTCGCCGTATTTCTTCTAGTTTTGCCGCTTTCGGCATACGCAACCACCTTCGATGTCCGGGACCACGGAGTCAAAAACGGAGATATCACCGATGCTCTGTTGAAAGCATGGAAGCTAGCTTGCAACTCGTCTACGCCTGCGAAGGTGTATGTGGGTCCAGGTACGTGGACCCTGAGGCAGGCTCTGTTGGCGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009565
ATGGAACAAAAGCATCTCATCTCCGTCGCCGTATTTCTTCTAGTTTTGCCGCTTTCGGCATACGCAACCACCTTCGATGTCCGGGACCACGGAGTCAAAAACGGAGATATCACCGATGCTCTGTTGAAAGCATGGAAGCTAGCTTGCAACTCGTCTACGCCTGCGAAGGTGTATGTGGGTCCAGGTACGTGGACCCTGAGGCAGGCTCTGTTGGCGGGACCCAACAAGTCCCCCATCGAGCTGCAGGTGCAGGGCACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792961.1
MEQKHLISVAVFLLVLPLSAYATTFDVRDHGVKNGDITDALLKAWKLACNSSTPAKVYVGPGTWTLRQALLAGPNKSPIELQVQGTVKAPADPYQLPDKQKEWITINYLNYFTLFGGGVFDGQGKIAWTKNDCHKNKNCMKLPMNLSFNFINNSLIKDVTTKDSKNFHVNLMSSGNVTFQRFRISAPAESPNTDGLHIARSVGVKVIDSIIETGDDCISFGDELTDVLIKNVKCGPGHGISIGSLGRSTQEKDVSKVTID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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