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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005605`

染色体: Chr02 坐标: 75748376-75752116 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005605`
名称	SmilChr02G005605
描述	BTB/POZ domain-containing protein At2g04740
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75748376 - 75752116 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009571`
GeneID	`131009571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009571`
原始查询	`SmilChr02G005605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At2g04740
产物	BTB/POZ domain-containing protein At2g04740
Arabidopsis	`AT2G04740` (AT2G04740) ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815017] identity=71.3; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0318200` - identity=64.5; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000151 (ubiquitin ligase complex); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792970.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792970.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057792970.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792970.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75748523`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr2:75748523`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84
`Chr2:75749076`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B112,B91,C9
`Chr2:75749076`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B112,B91,C9
`Chr2:75749399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:75751865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792970.1

592 aa

296

592

Ank_4

Ank_2

BTB

PF13637 Ank_4 35-83 aa PF12796 Ank_2 36-110 aa PF00651 BTB 172-268 aa PF00651 BTB 334-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792970.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	35	83	1e-08	35.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057792970.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	36	110	1.3e-06	29.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057792970.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	172	268	1.1e-31	110.0	BTB/POZ domain
`XP_057792970.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	334	437	1.1e-31	110.0	BTB/POZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936987.1
TTTTGTTGAAAAGCACGAGGATTGTTGTAGCGGCATAGCAGGCAAGTAAGAGTGAAGGGTGAGATGTCGGGCGGCGGCATTTGGTCGGAGCTAGACGATATAGAGCTGGAGGCGGCGGACTTCCACTCCTCACTGCCGCTGAAGAAGGTCCCTTACGGAGACATTTTCGAGGCCTCCCGCGCCGGCGACGTCGACCGCCTCCGCTCTCTGTTGGAGTCCGGCGTCAACGTCAACGCCCGCGACCAATGGGACTCCGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009571
ATGTCGGGCGGCGGCATTTGGTCGGAGCTAGACGATATAGAGCTGGAGGCGGCGGACTTCCACTCCTCACTGCCGCTGAAGAAGGTCCCTTACGGAGACATTTTCGAGGCCTCCCGCGCCGGCGACGTCGACCGCCTCCGCTCTCTGTTGGAGTCCGGCGTCAACGTCAACGCCCGCGACCAATGGGACTCCGTCGCCCTCTACTACGCCTGCCTGGCCGGCCATCTCGACGCTGCCCGGATGCTCCTGGAGAGCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792970.1
MSGGGIWSELDDIELEAADFHSSLPLKKVPYGDIFEASRAGDVDRLRSLLESGVNVNARDQWDSVALYYACLAGHLDAARMLLESGAICSEHTFDGDRCHYAALNLKVRKLLKSFEARPPPLQPLQAALRDTFLSCEANTAYLQHQFQFNFTSLLSVGHSSQGESSSCYCPPDFVFYVQGRPLEAHRLILAARSPFFKKKFETDWKHRKEVRFSREKLSYPSLFSLVHFFYSDRLEVAVDDMEDLVRICKVCKCQSLQSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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