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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000007`

染色体: Chr03 坐标: 90718-93379 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000007`
名称	SmilChr03G000007
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-B-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	90718 - 93379 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016988`
GeneID	`131016988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016988`
原始查询	`SmilChr03G000007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-B-like
产物	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-B-like
Arabidopsis	`AT1G14450` (AT1G14450) NADH dehydrogenase (ubiquinone)s [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838007] identity=73; qcov=0.9; evalue=5.89e-32; confidence=medium
Rice	`Os02g0564200` (P0020C11.12-1) - identity=71; qcov=0.886; evalue=7.57e-22; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005747 (GO:0005747); GO:0022900 (electron transport chain); GO:0032981 (mitochondrial respiratory chain complex I assembly)
KEGG	-
Pfam	PF08122 (NDUF_B12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057801829.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057801829.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057801831.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801829.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:93187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:93225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A10,A18,A2,A21,B103,B119,B128,B133,B21,B22,B23,B29,B34,B38,B39,B65,B88,B90,B92,B95,C31,C49,C57,C60,C87
`Chr3:93333`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr3:93333`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr3:93354`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	161	A10,A14,A16,A19,A2,A22,A24,A3,A4,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B12,B121,B123,B125,B128,B130,B131,B132,B133,B135,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B5,B57,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C32,C35,C37,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C52,C55,C57,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C72,C73,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C84,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801829.1

93 aa

NDUF_B12

PF08122 NDUF_B12 37-79 aa

XP_057801831.1

70 aa

NDUF_B12

PF08122 NDUF_B12 14-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801829.1`	Pfam	`PF08122`	NDUF_B12	Family	37	79	1.4e-07	32.0	NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family
`XP_057801831.1`	Pfam	`PF08122`	NDUF_B12	Family	14	56	7e-08	32.9	NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945846.1
CCATGTCTCATTTCTCATTTCTCACCTGGTATCCAACAGAAGGGGGAGAGAAGCAAAAGAGAGCATCGTTAATGTCGAAGCCACTAGGAACAACGGGAGAGTTTTTCAAGCGGCGCGACGAATGGCGGAAGCACCCGATGCTCACCAACCAGTGGCGCCACGCCACCCCCGGCCTGGGCATCGCGCTCGTCGCCTTCGGTATTTACCTTGTCGGTGAAACCGCTTATAACAAGATCTACGCCCCAAAATCTGATTCTCAC...

XM_057945848.1
TTCTCATTTCTCACCTGGTATCCAACAGAAGGGGGAGAGAAGCAAAAGAGAGCATCGTTAATGTCGAAGCCACTAGGAACAACGGGAGAGTTTTTCAAGCGGCGCGACGAATGGCGGAAGCACCCGATGCTCACCAACCAGTGGCGCCACGCCACCCCCGGCCTGGGCATCGCGCTCGTCGCCTTCGGTATTTACCTTGTCGGTGAAACCGCTTATAACAAGATCTACGCCCCAAAATCTGATTCTCACTCCACCTCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016988
ATGTCTCATTTCTCATTTCTCACCTGGTATCCAACAGAAGGGGGAGAGAAGCAAAAGAGAGCATCGTTAATGTCGAAGCCACTAGGAACAACGGGAGAGTTTTTCAAGCGGCGCGACGAATGGCGGAAGCACCCGATGCTCACCAACCAGTGGCGCCACGCCACCCCCGGCCTGGGCATCGCGCTCGTCGCCTTCGGTATTTACCTTGTCGGTGAAACCGCTTATAACAAGATCTACGCCCCAAAATCTGATTCTCACTC...

LOC131016988
ATGTCGAAGCCACTAGGAACAACGGGAGAGTTTTTCAAGCGGCGCGACGAATGGCGGAAGCACCCGATGCTCACCAACCAGTGGCGCCACGCCACCCCCGGCCTGGGCATCGCGCTCGTCGCCTTCGGTATTTACCTTGTCGGTGAAACCGCTTATAACAAGATCTACGCCCCAAAATCTGATTCTCACTCCACCTCTTCCGCTTCTCACTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801829.1
MSHFSFLTWYPTEGGEKQKRASLMSKPLGTTGEFFKRRDEWRKHPMLTNQWRHATPGLGIALVAFGIYLVGETAYNKIYAPKSDSHSTSSASH

XP_057801831.1
MSKPLGTTGEFFKRRDEWRKHPMLTNQWRHATPGLGIALVAFGIYLVGETAYNKIYAPKSDSHSTSSASH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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