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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000008`

染色体: Chr03 坐标: 94884-97333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000008`
名称	SmilChr03G000008
描述	auxin efflux carrier component 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	94884 - 97333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016906`
GeneID	`131016906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016906`
原始查询	`SmilChr03G000008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin efflux carrier component 5-like
产物	auxin efflux carrier component 5-like
Arabidopsis	`AT5G16530` (PIN5) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831515] identity=65; qcov=1; evalue=6.03e-169; confidence=high
Rice	`Os01g0919800` (OsPIN5a) - identity=58.1; qcov=1.01; evalue=7.08e-145; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009926 (auxin polar transport); GO:0010315 (auxin export across the plasma membrane); GO:0010329 (auxin efflux transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801689.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801689.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057801689.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801689.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801689.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:95017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:95115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:95174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B23
`Chr3:95220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C37
`Chr3:95247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:95364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B123,C46,C64,C66
`Chr3:95367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:95471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:95520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:95578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B88,C40
`Chr3:95885`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	175	A11,A14,A15,A18,A20,A21,A22,A24,A25,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B110,B113,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B5,B50,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B99,C10,C13,C17,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C43,C44,C46,C49,C50,C51,C52,C55,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C70,C71,C72,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:96775`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A10,A3,B136,C46,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801689.1

371 aa

186

371

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 10-364 aa

XP_057801690.1

360 aa

180

360

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 10-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801689.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	10	364	5.4e-69	233.1	Membrane transport protein
`XP_057801690.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	10	353	6.3e-75	252.6	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945707.1
GATCTGTAAAATATGCTAAAGTAATGTATTTATTCTATGTACGTATATTATAAATATACATATAGGCTCATTGTGAAAGAACATATATAGTTTAGTTAAACATCATCAAGCAAGAATGATAGGATGGGAAGATGTGTGGAAGGTGGTTGAGGCGATGGCGCCGCTATACGCAGCCCTAATGTTGGGATACGGGTCGGTGAAATGGTGGCGAATATTGCGGGTGGAGCAGTGCGAGGCCATCAACCTGCTAGCGTACTACT...

XM_057945706.1
AAACATCATCAAGCAAGAATGATAGGATGGGAAGATGTGTGGAAGGTGGTTGAGGCGATGGCGCCGCTATACGCAGCCCTAATGTTGGGATACGGGTCGGTGAAATGGTGGCGAATATTGCGGGTGGAGCAGTGCGAGGCCATCAACCTGCTAGCGTACTACTTCACGTATCCCATGTTTGTGTTCGAGTTCACCGCCCACGCAGACCCTTTCACCATGAACTATACATTCATGGCCGCGGATGCGATTTCGAAGGTGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016906
ATGATAGGATGGGAAGATGTGTGGAAGGTGGTTGAGGCGATGGCGCCGCTATACGCAGCCCTAATGTTGGGATACGGGTCGGTGAAATGGTGGCGAATATTGCGGGTGGAGCAGTGCGAGGCCATCAACCTGCTAGCGTACTACTTCACGTATCCCATGTTTGTGTTCGAGTTCACCGCCCACGCAGACCCTTTCACCATGAACTATACATTCATGGCCGCGGATGCGATTTCGAAGGTGATAATAGTGGCGGTGCTGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801689.1
MIGWEDVWKVVEAMAPLYAALMLGYGSVKWWRILRVEQCEAINLLAYYFTYPMFVFEFTAHADPFTMNYTFMAADAISKVIIVAVLACWAKWCSKGNYCWSITSFSLTTLTNSLVVGVPFLKAMYGQMGVDLVVQSSVFQALVWLTILLFILELKHTRDIDLHRPSPTQIDHDLENLPTTDALQKEIINRNTPPPLSLRKLIKEVSIKISKNPNSYACMLGVTWAFISNRWHFSMPSIVEGSILIMSRAGTGTAMFSMGE...

XP_057801690.1
MIGWEDVWKVVEAMAPLYAALMLGYGSVKWWRILRVEQCEAINLLAYYFTYPMFVFEFTAHADPFTMNYTFMAADAISKVIIVAVLACWAKWCSKGNYCWSITSFSLTTLTNSLVVGVPFLKAMYGQMGVDLVVQSSVFQALVWLTILLFILELKHTRDIDLHRPSPTQIDHDLENLPTTDALQKEIINRNTPPPLSLRKLIKEVSIKISKNPNSYACMLGVTWAFISNRWHFSMPSIVEGSILIMSRAGTGTAMFSMGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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