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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000015`

染色体: Chr03 坐标: 150067-153412 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000015`
名称	SmilChr03G000015
描述	GDT1-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	150067 - 153412 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016931`
GeneID	`131016931`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016931`
原始查询	`SmilChr03G000015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDT1-like protein 3
产物	GDT1-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G36290` (AT5G36290) Uncharacterized protein family (UPF0016) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833627] identity=68.4; qcov=1.02; evalue=5.91e-128; confidence=high
Rice	`Os11g0472500` - identity=77.3; qcov=0.892; evalue=9.84e-135; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015085 (calcium ion transmembrane transporter activity); GO:0032468 (Golgi calcium ion homeostasis); GO:0032472 (Golgi calcium ion transport); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport); GO:0071421 (manganese ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01169 (GDT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057801721.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057801721.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801721.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801721.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:150342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:150534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B114,B70,C15,C31
`Chr3:151303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:151345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:152296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:152577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:153029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:153035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B14,B75,C31
`Chr3:153095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B104,B75,C31,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801721.1

296 aa

148

296

GDT1

PF01169 GDT1 89-173 aa PF01169 GDT1 213-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801721.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	89	173	1.9e-46	156.9	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057801721.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	213	289	1.9e-46	156.9	Divalent cation/proton antiporter GDT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945738.1
CGTCAAACCCAAGCAAAATTAAAATTTCGAAATCCAAAATATATAAAATGCCCATAAATTTAGATTCACTGTAATGATTCAGATTTTCGGAGAGACTTTACTGAAATTTGGAGAAATCAAAATATCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTGTCGCTAATGCCGGCGTAGATCCCAATCTGCAATTTCCCTTTTCCGGTCGAGATCCCCCCAATTGAGCTGCGAGCTCTGAAACTTGTTTTACTCATTCGTCAGATCGAATCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016931
ATGGGGGATTCGTCGCCACCGTATAGATTTCGAGGGAGATCATTCGCTGTTCACGTTTTCTTCTCATTTCTTCTATTCATATCTCTCTCCGTTCCCCTAATTTCTGCTCAGGAGAATGGAAGTGACGAGTCGAGTGCTGCAATTAAGGATCTGGGCCGGCGTAGTAAAATGTTTGTGGACAAAATCAAGACCGGAATCAACGAAAAAAATGATGATGATTCTTTTGGCGTGGATGTGGACTCTGGCCTTGGAATCTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801721.1
MGDSSPPYRFRGRSFAVHVFFSFLLFISLSVPLISAQENGSDESSAAIKDLGRRSKMFVDKIKTGINEKNDDDSFGVDVDSGLGIFDGFIASLSMILVSEIGDETFIIAALMAMRHPKSIVLSGALSALFVMTILSTGLGRIVPNLISRKHTNSAATVLYLFFGLRLLYIAWKSDPKASQKKEIEEAEEKLESGQGKSTWRRFFSRFCTPIYLESFILTFLAEWGDRSQIATIALATHKNAVGVAAGATIGHTICTSVAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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