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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000017`

染色体: Chr03 坐标: 179982-182569 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000017`
名称	SmilChr03G000017
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g58880
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	179982 - 182569 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016873`
GeneID	`131016873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016873`
原始查询	`SmilChr03G000017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At3g58880
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At3g58880
Arabidopsis	`AT1G52650` (AT1G52650) F-box/RNI superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841697] identity=23.8; qcov=0.953; evalue=2.31e-11; confidence=weak
Rice	`Os07g0163200` (OsFbox344) - identity=25.5; qcov=0.897; evalue=1.08e-22; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801637.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801637.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801637.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801637.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:181681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr3:181724`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D5
`Chr3:181724`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D5
`Chr3:181945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,C11,C79,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801637.1

485 aa

242

485

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 21-55 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 190-484 aa

XP_057801638.1

485 aa

242

485

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 21-55 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 190-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801637.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	55	6.1e-05	23.5	F-box domain
`XP_057801637.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	190	484	3.5e-25	89.9	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057801638.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	55	6.1e-05	23.5	F-box domain
`XP_057801638.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	190	484	3.5e-25	89.9	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945655.1
AAATTGATACCAATTTATAATTTCATTAAGTTGTAACTAATAGAATAGGGCTTCCATTCCCCACGAATACAGCTTCTGCCTTCTGGTTCTGGTTTGTACGACCCGCCGCCAGCGACCTCTTCCCACCGGACCACGTCGCCGGCACGTATTCCCAGTTTTTTCCGCGCCTGAGCACCATCTGCTAGAGCAGCTCGAGTTTTCCGCGCTTGAGCACCTTCTGCCTCTTTCGACTTTTTCTCCTTTCCCGAGCACCACGACCA...

XM_057945654.1
TCATTAAGTTGTAACTAATAGAATAGGGCTTCCATTCCCCACGAATACAGCTTCTGCCTTCTGGTTCTGGTTTGTACGACCCGCCGCCAGCGACCTCTTCCCACCGGACCACGTCGCCGGCACGTATTCCCAGTTTTTTCCGCGCCTGAGCACCATCTGCTAGAGCAGCTCGAGTTTTCCGCGCTTGAGCACCTTCTGCCTCTTTCGACTTTTTCTCCTTTCCCGAGCACCACGACCAGTCCTGCTCATTCTCCGGCAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016873
ATGTTGAAAGAGAAGCGGGAGCGATTGGCCATCTCTACAGATGTATCCAAGGTTGATCGAATTAGCGTGCTACCGAAAGAAGTATTAGGGTTGATATTGTCTTTGTTGACGGCCAAGGAAGCTACTGCAACTAGCATACTTTGTAGTTCATGGAGATACTTGTGGGTCTTAACTTGTAAGACGACGATGGATTTTGATGGCACACAATCAGTACGTAAGATTATTAGATTTATGGAAAATTTTGGATTCACGGATCCATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801637.1
MLKEKRERLAISTDVSKVDRISVLPKEVLGLILSLLTAKEATATSILCSSWRYLWVLTCKTTMDFDGTQSVRKIIRFMENFGFTDPSVNKACIEPLEEERCKFVRWVDHVIVSNQLLDQRSNLEEFKVYFDLNQTHREKIDDWLTYAFSRKVERLELRLTSLARGIARFYPDSHLCYEFPYKRGNLPNNFEVLKKLCLHLVSVSGEVVQLFLEKCPLLEQVSVSGSQALLSLEIVATFPSFKCLEISLCHYLKSVVLRDS...

XP_057801638.1
MLKEKRERLAISTDVSKVDRISVLPKEVLGLILSLLTAKEATATSILCSSWRYLWVLTCKTTMDFDGTQSVRKIIRFMENFGFTDPSVNKACIEPLEEERCKFVRWVDHVIVSNQLLDQRSNLEEFKVYFDLNQTHREKIDDWLTYAFSRKVERLELRLTSLARGIARFYPDSHLCYEFPYKRGNLPNNFEVLKKLCLHLVSVSGEVVQLFLEKCPLLEQVSVSGSQALLSLEIVATFPSFKCLEISLCHYLKSVVLRDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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