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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000041`

染色体: Chr03 坐标: 470087-478916 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000041`
名称	SmilChr03G000041
描述	uncharacterized SmilChr03G000041
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	470087 - 478916 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016892`
GeneID	`131016892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016892`
原始查询	`SmilChr03G000041`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0414000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0414000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G36230` (AT5G36230) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833620] identity=79.2; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0414000` - identity=82.5; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02020 (W2); PF25504 (HEAT_5MP1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801661.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801661.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057801661.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801661.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:475901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A9,B10,B53
`Chr3:475902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C68,D7
`Chr3:475913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:475918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B56,B73,B91,B96
`Chr3:475919`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr3:475919`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr3:477283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:477288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B25,C41,C84
`Chr3:477314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr3:477375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:477842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B73
`Chr3:477879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B49,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801661.1

411 aa

206

411

HEAT_5MP1_2

PF25504 HEAT_5MP1_2 14-252 aa PF02020 W2 338-411 aa

XP_057801662.1

411 aa

206

411

HEAT_5MP1_2

PF25504 HEAT_5MP1_2 14-252 aa PF02020 W2 338-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801661.1`	Pfam	`PF25504`	HEAT_5MP1_2	Repeat	14	252	4e-82	276.2	5MP1/2 HEAT domain
`XP_057801661.1`	Pfam	`PF02020`	W2	Repeat	338	411	3.5e-20	72.6	eIF4-gamma/eIF5/eIF2-epsilon
`XP_057801662.1`	Pfam	`PF25504`	HEAT_5MP1_2	Repeat	14	252	4e-82	276.2	5MP1/2 HEAT domain
`XP_057801662.1`	Pfam	`PF02020`	W2	Repeat	338	411	3.5e-20	72.6	eIF4-gamma/eIF5/eIF2-epsilon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945679.1
TTTGCTCCTTCTCTCTCTATACCTCTCTCTTTGCTTCGCGAGAGTCTCTTCAGACTCTGCCCTCTATTTGATTCCCTTAAGATCGGTTTATGAGCTCGAAGGAGAAACCCACTCTCGGTGGTACGCGGATTAAGACCCGCAAACGGAATATTGCTGCGCCACTGGACCCTGCAGCATTCTCGGATGCAGTGGTCCAGATTTATTTGGATAATGCTGGTGATCTGGAACTTATTGCAAAGTGCATTGAATCTTCAGACCTC...

XM_057945678.1
CTAGACCACTATGAGCAAAAAGTGCATCTGCCGTGTTAATCACTTGTGCTGTGTGCTTTGTTTCTTGTACTTTCCTAATACTCCTATAAGGTTTTCTTTTTTCCATTATTTATTATTTTCCTTTCCAGTATATATATTATTTTCGTTTTGCCCTTTTCCCCATTCAACACTTCTGATTTGCATCACCCCTCTTCCTTCTCTCTATACCCCTCTCTGTCTTTCTCTTTGCTTCGCGAGAGTCTCTTCAGACTCTGCCCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016892
ATGAGCTCGAAGGAGAAACCCACTCTCGGTGGTACGCGGATTAAGACCCGCAAACGGAATATTGCTGCGCCACTGGACCCTGCAGCATTCTCGGATGCAGTGGTCCAGATTTATTTGGATAATGCTGGTGATCTGGAACTTATTGCAAAGTGCATTGAATCTTCAGACCTCAATTTCTCAAGATACGGCGATACCTTTTTTGAGGTGGTATTCAGAGGTACCCGTACACAGCCTGGCACTATCAAGCTTGATGAGGGGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801661.1
MSSKEKPTLGGTRIKTRKRNIAAPLDPAAFSDAVVQIYLDNAGDLELIAKCIESSDLNFSRYGDTFFEVVFRGTRTQPGTIKLDEGERHPYSIIDCEPSREVILPSVIYIQKLLRRRPFLIKSLENVMQKFLQSLELFEQDERKKLAIFTALAFSQKLSGLPPETVFQPLLKDNLIEKGLVLSFITDFFKEYLVDNSLDDLIAILKRAKIEDSLMDFFPSAKRTPEALSEHFTKEGLLLLVEYNEKKLFEVKLKEMKTAI...

XP_057801662.1
MSSKEKPTLGGTRIKTRKRNIAAPLDPAAFSDAVVQIYLDNAGDLELIAKCIESSDLNFSRYGDTFFEVVFRGTRTQPGTIKLDEGERHPYSIIDCEPSREVILPSVIYIQKLLRRRPFLIKSLENVMQKFLQSLELFEQDERKKLAIFTALAFSQKLSGLPPETVFQPLLKDNLIEKGLVLSFITDFFKEYLVDNSLDDLIAILKRAKIEDSLMDFFPSAKRTPEALSEHFTKEGLLLLVEYNEKKLFEVKLKEMKTAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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