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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000047`

染色体: Chr03 坐标: 499352-502157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000047`
名称	SmilChr03G000047
描述	serine carboxypeptidase-like 20
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	499352 - 502157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016864`
GeneID	`131016864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016864`
原始查询	`SmilChr03G000047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 20
产物	serine carboxypeptidase-like 20
Arabidopsis	`AT4G12910` (scpl20) serine carboxypeptidase-like 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826903] identity=61.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0257000` (CBP1) - identity=61.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups); GO:0019748 (secondary metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057801625.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801625.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801625.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801626.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801626.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:499631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr3:499989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B5,B57,C46,D10
`Chr3:499994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,C14,C2,C29,C7
`Chr3:500010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B5,B57,C46
`Chr3:500013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C65
`Chr3:500133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:500147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:500328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B91,C82
`Chr3:500398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C27,C72
`Chr3:500465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B123,B36,C16,C3
`Chr3:500488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:500839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801625.1

499 aa

250

499

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-495 aa

XP_057801626.1

497 aa

248

497

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-493 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801625.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	495	6.6e-133	444.8	Serine carboxypeptidase
`XP_057801626.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	493	1.9e-135	453.2	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099247.1
AACAAATTTGTCTCATCTTTCTGTTTTCCCCTCCCTCCCCCATCTTGATGCTTCTCCAAAAACACCATCAACTCTCTTCTTAGACTTCTCTCTCTCACTCTCTCCCTCTCTCTCTCATACACAGGAACGGTGAGACAAAGCCGCCATGGCCGGGCACAAAGTAGCCCTTTTTCCGGTGAGTATGCTAGTATGCATGTTTCTGCAGCTGCACCTTGTTGAACCAGCTCCTCAACTTTCTCTGGTAAGGAGTCTTCCTGGAT...

XR_009099248.1
AACAAATTTGTCTCATCTTTCTGTTTTCCCCTCCCTCCCCCATCTTGATGCTTCTCCAAAAACACCATCAACTCTCTTCTTAGACTTCTCTCTCTCACTCTCTCCCTCTCTCTCTCATACACAGGAACGGTGAGACAAAGCCGCCATGGCCGGGCACAAAGTAGCCCTTTTTCCGGTGAGTATGCTAGTATGCATGTTTCTGCAGCTGCACCTTGTTGAACCAGCTCCTCAACTTTCTCTGGTAAGGAGTCTTCCTGGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016864
ATGGCCGGGCACAAAGTAGCCCTTTTTCCGGTGAGTATGCTAGTATGCATGTTTCTGCAGCTGCACCTTGTTGAACCAGCTCCTCAACTTTCTCTGGTAAGGAGTCTTCCTGGATTCAAAGGAACGTTCCCATCAAAGCATTACTCGGGGTATGTGACACTAGAGGGGAACCACCCCCCAAAGAACCTCTTCTACTACTTTGTGGTGTCGGAGAGAAGCCCTGCACACGATCCTCTTGTTCTGTGGCTAAATGGAGGACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801625.1
MAGHKVALFPVSMLVCMFLQLHLVEPAPQLSLVRSLPGFKGTFPSKHYSGYVTLEGNHPPKNLFYYFVVSERSPAHDPLVLWLNGGPGCSSFDGFVYEHGPFNFEASKGGGLPVLHLNPYSWSKVASIIYLDSPVGVGFSYSANTSYYVNGDLQTAAETHLFLLKWLEEFREFKTNPFYIAGESYAGIYVPTLASLVVNGIKNGTKPKINFKGYMVGNGVCDSHFDGNALIPFAHGMGLISDMMYKEAEAVCRGNYLNSL...

XP_057801626.1
MAGHKVALFPVSMLVCMFLQLHLVEPAPQLSLVRSLPGFKGTFPSKHYSGYVTLEGNHPPKNLFYYFVVSERSPAHDPLVLWLNGGPGCSSFDGFVYEHGPFNFEASKGGGLPVLHLNPYSWSKVASIIYLDSPVGVGFSYSANTSYYVNGDLQTAAETHLFLLKWLEEFREFKTNPFYIAGESYAGIYVPTLASLVVNGIKNGTKPKINFKGYMVGNGVCDSHFDGNALIPFAHGMGLISDMMYKEAEAVCRGNYLNSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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